二肽酶1;DPEP1

二肽酶 1,肾脏
肾二肽酶;RDP
脱氢肽酶I
微粒体二肽酶;MDP
膜结合二肽酶 1;MBD1

HGNC 批准的基因符号:DPEP1

细胞遗传学定位:16q24.3 基因组坐标(GRCh38):16:89,613,308-89,641,540(来自 NCBI)

▼ 说明

DPEP1(EC 3.4.13.11)是一种肾膜酶,可水解多种二肽,参与谷胱甘肽及其结合物(例如白三烯D4)的肾代谢(Kozak and Tate,1982)。DPEP1负责水解抗生素的β-内酰胺环,例如青霉烯类和碳青霉烯类(Campbell et al., 1984)。早些时候,β-内酰胺酶被认为只存在于细菌中,其可能的功能是保护生物体免受β-内酰胺抗生素的作用。这些抗生素对细菌表现出选择性毒性,但对许多真核细胞几乎呈惰性(Adachi et al., 1990)。

▼ 克隆与表达

Adachi 等人(1990)分离并表征了人类 DPEP1 的 cDNA 克隆,他们将其称为 RDP。DNA和RNA印迹分析表明单个基因的存在。

为了分离与肾母细胞瘤相关的潜在肿瘤/生长抑制基因,Austruy等人(1993)通过克隆除去过量肾母细胞瘤mRNA的成熟肾脏cDNA构建了cDNA文库。根据差异表达模式选择克隆,即来自成熟肾脏的RNA呈阳性,而来自几个肾母细胞瘤的RNA呈阴性。通过将这些克隆的序列与数据库序列进行比较,1个克隆被鉴定为DPEP1。

Nitanai et al.(2002)指出RDP是相同的369个氨基酸子单元的同型二聚体。每个子单元的计算分子量约为 42 kD,但 4 个可能位点的 N-糖基化会产生约 63 kD 的高度糖基化肽。此外,每个 RDP 子单元都有一个 C 端糖基磷脂酰肌醇膜锚。

Habib et al.(2003)克隆了小鼠Dpep1,他们将其命名为Mbd1。Northern印迹分析检测到3个转录本在心脏、肺、骨骼肌、肾脏、肝脏和睾丸中差异表达。在大脑和脾脏中未检测到 Mbd1 表达。这些转录本可能是由于使用了替代的聚腺苷酸位点和 5 素 UTR 的变化而产生的。

▼ 生化特征

Nitanai et al.(2002)确定了人RDP的晶体结构。每个子单元似乎呈现由 8 个 α 螺旋和 β 折叠对组成的桶形。每个单体需要 2 个锌离子,这些锌离子连接到酶袋底部的催化残基(glu125、his198 和 his219)。His152 不与锌连接,但它负责识别底物或抑制剂。该口袋由 2 个相邻的二硫键和 3 个脯氨酸残基加固。Cys361 参与单体之间的二硫桥。

▼ 基因功能

Kera 等人(1999)使用甘氨酰-D-丙氨酸作为底物测量了几种人类死后组织和大鼠组织中的二肽酶活性。在人体组织中,肾皮质、胰腺和睾丸的活性最高。在肾上腺和肝脏中检测到低得多的活性,在肺、脾、大脑和小脑中检测到非常低的活性。在健康志愿者的血清和尿液中也发现了这种酶。大鼠的活动相似,但肺部的活动要高得多。出生后直至 8 周龄的大鼠各组织中酶活性的分布都发生了变化。

Habib et al.(2003)证明,转染小鼠Mbd1的COS-7细胞能够将白三烯D4转化为白三烯E4,并且能够水解胱氨酰双甘氨酸(cys-bis-gly)和β-内酰胺。青霉胺对 Mbd1 的抑制表明它是一种金属肽酶。

▼ 基因结构

Satoh等(1993)确定DPEP1基因包含10个外显子,跨度约6 kb。

▼ 测绘

Nakakawa等(1991)通过FISH将RDP基因定位到染色体16q24。

Austruy 等人(1993)使用携带不同人类染色体或染色体 16 片段的体细胞杂种来确认和完善 DPEP1 到 16q24.3 的物理映射。描述了两个 RFLP 并用于显示 DPEP1 与 D16S7 的连接;θ 为 0.03 时,最大 lod 得分为 5.8。

▼ 动物模型

Habib 等人(1998)发现,Mbd1 缺陷小鼠保留了部分降解 cys-bis-gly 的能力以及将白三烯 D4 转化为白三烯 E4 的能力,具体取决于所检查的组织。Habib et al.(2003)提出Mbd2(DPEP2;609925)和Mbd3(DPEP3;609926)部分补偿了这些小鼠中Mbd1的损失。

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