组蛋白脱乙酰酶 9; HDAC9

组蛋白去乙酰化酶 7B; HDAC7B
MEF2-相互作用转录抑制蛋白; MITR
KIAA0744

此条目中代表的其他实体：

包含组蛋白脱乙酰酶 9A；HDAC9A，包含

HGNC 批准的基因符号：HDAC9

细胞遗传学定位：7p21.1 基因组坐标（GRCh38）：7:18,086,825-19,002,416（来自 NCBI）

▼ 说明

乙酰化和脱乙酰化由组蛋白乙酰转移酶（如 HAT1（603053））和组蛋白脱乙酰酶（如 HDAC9）介导，在基因表达调控中发挥作用。

▼ 克隆与表达

通过筛选编码大脑中表达的大蛋白的cDNA，Nagase等人（1998）鉴定了编码HDAC9的部分cDNA，他们将其命名为KIAA0744。推导的590个氨基酸的蛋白与KIAA0288（HDAC4）的N端有53%的一致性；605314）。RT-PCR分析检测到大脑中表达最高，心脏和平滑肌中表达较低，其他组织中表达很少或没有表达。

Sparrow等人（1999）利用酵母2-杂交筛选青蛙Mef2d（见600663），获得了小鼠Mitr（Mef2相互作用转录抑制子）及其人类同源物MITR，与KIAA0744相同，但缺少C-终端 HDAC 域。功能分析表明 MITR 作为曲古抑菌素 A（TSA）敏感的转录抑制因子，并直接与 HDAC1（601241）相互作用。

通过使用根据 MITR 染色体 7 下游假定的 HDAC 结构域设计的引物对脑 cDNA 进行 RACE-PCR，Zhou 等人（2001）分离出编码全长 HDAC9 和较短亚型（称为 HDAC9A）的 cDNA。他们将 MITR 称为 HDRP（组蛋白脱乙酰酶 4/5 相关蛋白）。序列分析预测较长的亚型包含 1,011 个氨基酸和一个 HDAC 结构域，而 HDAC9A 拥有 879 个氨基酸，在 C 末端缺少 132 个残基。Northern 印迹分析揭示了 9.8-和 4.1-kb 转录物普遍存在但变化的表达。RT-PCR 分析检测到 HDAC9 在脑、心脏和胰腺中优先表达，而 HDAC9A 在肺、肝脏和骨骼肌中占主导地位。在胎盘和肾脏中的表达是相同的。功能分析表明，两种亚型具有相当的 TSA 抑制 HDAC 活性，但活性比 HDAC4 低得多。Western blot分析表明HDAC9和HDAC9A与MITR一样，特异性抑制MEF2C（600662）介导的转录激活。Zhou et al.（2001）得出结论，HDAC9至少有6种剪接变体，包括缺乏外显子7编码的核定位信号的亚型。

▼ 基因结构

通过基因组序列分析，Sparrow et al.（1999）确定MITR包含12个外显子，覆盖染色体7上总共173 kb。他们注意到在MITR 3-prime UTR下游56 kb处存在潜在编码HDAC结构域的序列，表明总基因座长 454 kb。Zhou et al.（2001）确定全长基因包含23个外显子，跨度458 kb。他们还解释了不同 HDAC9 同工型的可变外显子用法。

▼ 基因功能

Youn等人（2000）报道HDAC4和MITR含有与其MEF2结合域重叠的钙调蛋白（114180）结合域。钙调蛋白与 HDAC4 的结合导致其与 MEF2 解离，从而使 MEF2 免受 HDAC4 的转录抑制。HDAC4、MITR 和 CABIN1（604251）共同构成了 MEF2 的钙敏感转录抑制因子家族。

运动神经支配产生的电活动控制许多骨骼肌基因的表达。Mejat et al.（2005）表明Hdac9是小鼠骨骼肌中的信号反应性转录抑制因子，去神经后下调，从而导致染色质乙酰化和乙酰胆碱受体（AChR）上调；见100690）表达式。防止去神经肌肉中 Hdac9 下调可以消除组蛋白过度乙酰化和肌生成素（MYOG；159980）和AChR基因。电活动和 Hdac9 对活性依赖性基因和染色质乙酰化的抑制是由 Mef2、Hdac1 和 Hdac3 介导的（605166）。Mejat et al.（2005）得出结论，HDAC9通过控制染色质的乙酰化状态介导神经元引发的电活动对活动反应基因的影响。

▼ 测绘

Nagase等（1998）通过辐射杂交分析将HDAC9基因定位到染色体7。Zhou等（2001）通过数据库分析将定位细化到染色体7p21-p15。