富含半胱氨酸的清道夫受体家族成员，具有 5 个结构域；SSC5D

拥有 5 个域的 SSCR 家庭成员
具有 5 个结构域的可溶性清除剂

HGNC 批准的基因符号：SSC5D

细胞遗传学定位：19q13.42 基因组坐标（GRCh38）：19:55,488,436-55,519,099（来自 NCBI）

▼ 说明

SSC5D属于富含半胱氨酸清道夫受体（SRCR）蛋白超家族（Goncalves et al., 2009）。

▼ 克隆与表达

Goncalves等人（2009）通过基因组序列分析和RT-PCR克隆了全长人SSC5D。推导的 1,573 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 166 kD。他们还发现了另一种转录物，它编码 953 个氨基酸的 C 端截短蛋白，计算出的分子量为 102 kD。全长SSC5D蛋白含有一个假定的N端信号肽、一个信号肽酶切割位点和3个asn-X-ser/thr序列序列，但它缺乏预测的跨膜区域，表明SSC5D是一种分泌蛋白。5 个 N 端 SRCR 结构域各自包含 8 个半胱氨酸，这是 SRCR B 组结构域的特征。全长 SSC5D 的 C 端结构域在 476 个氨基酸区域中包含 144 个潜在的 O-糖基化位点。全长人类 SSC5D 与其大鼠和小鼠直系同源物分别具有 68.8% 和 67.5% 的氨基酸同一性，在 SRCR 结构域中具有更高的同一性。对人体组织的 Northern 印迹分析在胎盘、脾脏和结肠中检测到近 5 kb 的显着转录物，在肺、心脏和肾脏中表达较弱。在胎盘、心脏、肺和脾脏中检测到了约3kb的额外转录物，并且在脾脏中检测到了3.5至4kb的转录物。RT-PCR 显示 SSC5D 在外周血单核细胞、原代巨噬细胞、单核细胞系 THP-1 和 T 细胞系 Jurkat E6.1 中表达，但在 B 细胞系 Kw-Bcl 和 MEC-1 中不表达。实时PCR显示长亚型在原代单核细胞、CD4（186940）阳性T细胞和CD8（见186910）阳性T细胞中表达，但在B淋巴细胞中不表达。在原代单核细胞或淋巴细胞中未检测到短亚型。

▼ 基因结构

Goncalves et al.（2009）确定SSC5D基因包含15个外显子，其中包括替代外显子13a，跨度约为30 kb。每个 SRCR 结构域均由单个外显子编码。外显子 13a 包含短亚型的终止密码子。

▼ 测绘

Goncalves等（2009）通过基因组序列分析确定SSC5D基因定位于染色体19q13.4。