碳水化合物磺基转移酶13;CHST13
软骨素 4-磺基转移酶 3;C4ST3
HGNC 批准的基因符号:CHST13
细胞遗传学定位:3q21.3 基因组坐标(GRCh38):3:126,524,155-126,543,291(来自 NCBI)
▼ 说明
C4ST3 将硫酸盐转移至软骨素中侧翼为 GlcUA 残基的 β-1,4-连接 GalNAc 的 C-4 羟基(Kang et al., 2002)。
▼ 克隆与表达
通过数据库检索,以人和大鼠HNK1-磺基转移酶(CHST10;606376)蛋白质作为查询,随后使用基于PCR的技术,Kang等人(2002)鉴定了人C4ST3(CHST13)。C4ST3 cDNA 编码预测的 341 个氨基酸的 II 型跨膜蛋白,具有 12 个氨基酸的胞质结构域和 311 个氨基酸的管腔结构域。它具有单个潜在的 N 连接糖基化位点,计算分子量为 39 kD。C4ST3蛋白与C4ST1(CHST11;610128)和 23% 至 29% 与 HNK1 磺基转移酶家族的其他几个成员。Northern 印迹分析在成人肝脏中检测到单个 1.2-kb 转录物。RNA 斑点印迹分析检测到 C4ST3 在成人肝脏中高水平表达,而在成人肾脏、淋巴结和胎儿肝脏中显着较低水平表达。
▼ 基因功能
Kang等人(2002)利用体外表达研究发现,C4ST3将硫酸盐转移至软骨素,但不转移至dermatan或GGnM-MCO。C4ST3 与 C4ST1 的区别在于其在 37 摄氏度下的不稳定性及其限制性表达模式。
▼ 基因结构
Kang等(2002)确定CHST13基因至少含有3个外显子。
▼ 测绘
Kang等(2002)通过基因组序列分析,将CHST13基因定位到染色体3q21.3。