ELKS/RAB6-互动/演员家族,成员 1;ERC1
RAB6 相互作用蛋白 2;RAB6IP2
ELKS GENE; ELKS
KIAA1081
此条目中代表的其他实体:
包含 ELKS/RET 融合基因
HGNC 批准的基因符号:ERC1
细胞遗传学定位:12p13.33 基因组坐标(GRCh38):12:989,959-1,495,933(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Nakata等(1999)在甲状腺乳头状癌中鉴定出ELKS基因,该基因的5-prime部分由于t(10;12)易位而通过基因重排与RET基因(164761)融合。他们利用部分 ELKS 序列,从人脑 cDNA 文库中克隆了全长 cDNA。推导的 948 个氨基酸蛋白质包含 9 个 α-螺旋卷曲螺旋结构域,其中包括预测二聚体形成的周期性七肽重复序列。Nakata等(1999)将该蛋白命名为ELKS,因为该蛋白44.1%的序列由谷氨酸(E)、亮氨酸(L)、赖氨酸(K)和丝氨酸(S)残基组成。Northern 印迹分析检测到 9.0 kb 转录物普遍表达,在心脏、胎盘、胰腺、甲状腺和睾丸中表达最高。在骨骼肌中也发现了 7.0、1.5 和 1.0 kb 的转录本,在几种组织中也发现了其他较小的转录本。
Kikuno 等人(1999)从人脑 cDNA 文库中克隆了 ELKS,并将其命名为 KIAA1081。通过 RT-PCR ELISA,他们发现所有测试的组织和大脑区域都有表达。在心脏、大脑、肺、卵巢、杏仁核和丘脑中发现最高表达。
▼ 基因功能
Nakata等(1999)通过对正常甲状腺组织和甲状腺乳头状癌的PCR分析发现,ELKS-RET融合转录物仅在肿瘤中表达。通过序列分析,他们确定ELKS的氨基酸691与RET的氨基酸713融合。从功能上讲,这种融合会将 RET 的激酶结构域与 ELKS 的卷曲螺旋结构并置。Nakata et al.(1999)指出,由于RET基因在甲状腺乳头状癌发生的甲状腺滤泡细胞中不表达,并且由于二聚化导致RET激活,因此RET与ELKS的融合会导致RET的激酶结构域被改变。在甲状腺癌组织中异常表达。他们还证实了融合蛋白在体内的二聚化。
Sigala et al.(2004)将ELKS鉴定为IKK复合体的重要调控子单元(见600664)。通过RNA干扰沉默ELKS表达可阻断NF-kappa-B(见164011)靶基因的诱导表达,包括NF-kappa-B抑制剂IKBA(164008)和促炎基因如环氧合酶-2(COX2;600262)和白细胞介素8(IL8;146930)。这些细胞也没有受到细胞因子响应而免受细胞凋亡的保护。Sigala et al.(2004)得出结论,ELKS可能通过将IKBA招募到IKK复合物中来发挥作用,从而在IKK激活中发挥调节作用。
Wu et al.(2006)证明ELKS是DNA损伤诱导的IKK激活的关键成分,作用于细胞质ATM(607585)-IKK复合物形成的下游。由于ATM在基因毒性应激诱导下也与ELKS相关联,Wu et al.(2006)提出了一个模型,其中包含NEMO(300248)、ATM、IKK催化子单元和ELKS的胞质信号复合物在基因毒性应激反应中组装起来介导 NF-κ-B 激活。
Lansbergen et al.(2006)利用基于质谱的分析方法鉴定出了 LL5-β(PHLDB2;610298)和ELKS作为CLASP(见605852)结合伙伴。LL5-β 和 ELKS 形成了一种复合物,与 CLASP 共定位于 HeLa 细胞的皮层和运动性成纤维细胞的前缘。LL5-β是皮质CLASP积累和微管稳定所必需的,LL5-β定位受PI3K调节(见601232),但孤立于微管。LL5-β和ELKS的皮质簇不与粘着斑重叠,但经常在其附近形成并影响其大小。Lansbergen et al.(2006)得出结论,LL5-β和ELKS可以形成磷脂酰肌醇3,4,5-三磷酸调节的皮质平台,CLASP将远端微管末端附着在该平台上。
▼ 基因结构
Yokota et al.(2000)确定ELKS基因包含19个外显子,长度为500 kb。5-prime侧翼区富含GC,包含多个SP1(189906)-和AP2(107580)-结合序列,并且没有CAAT或TATA框。他们证明,在甲状腺乳头状癌中观察到的 ELKS-RET 基因融合重排发生在 ELKS 的内含子 10 和 RET 的内含子 11 之间。
▼ 测绘
Nakata等(1999)通过辐射杂交分析将ELKS基因定位到染色体12p13。Yokota et al.(2000)通过FISH将定位细化为12p13.3。