ATP 结合框,亚族 A,成员 9;ABCA9
HGNC 批准的基因符号:ABCA9
细胞遗传学定位:17q24.2 基因组坐标(GRCh38):17:68,974,488-69,078,977(来自 NCBI)
▼ 说明
ABC 转运蛋白,例如 ABCA9,构成了一组复杂的结构相关的多跨跨膜蛋白,介导广谱底物跨细胞膜的易位(Piehler et al., 2002)。
▼ 克隆与表达
Piehler et al.(2002)使用与人ABCA6(612504)和ABCA8(612505)同源的简并引物对人巨噬细胞cDNA进行PCR,克隆了ABCA9。推导的 1,624 个氨基酸蛋白质的计算分子量约为 160 kD。它有 2 个核苷酸结合折叠,每个折叠都具有特征性的 Walker A 和 B 基序,以及 2 个跨膜结构域,每个跨膜结构域由 7 个跨膜片段组成。ABCA9 与 ABCA6 和 ABCA8 分别具有 60% 和 72% 的氨基酸同一性,并且与这些蛋白质一样,它仅在其 N 端核苷酸结合折叠中包含 ABC 转运蛋白特征序列。Piehler et al.(2002)还鉴定了ABCA9的3个剪接变体,它们编码266、1,435和1,440个氨基酸的蛋白质。最短的蛋白质仅包含 2 个 N 端跨膜片段,其他蛋白质在 C 端核苷酸结合折叠内被截短。RNA点印迹分析检测到所有成人和胎儿组织中ABCA9的表达,其中成人心脏、大脑和肝脏中的表达水平最高。
▼ 基因功能
Piehler et al.(2002)发现人类单核细胞分化为巨噬细胞可诱导编码全长蛋白和266个氨基酸亚型的ABCA9 mRNA表达。胆固醇超载抑制巨噬细胞中 ABCA9 的表达。Piehler et al.(2002)得出结论,这两种ABCA9变体的表达是共同调节的,并且ABCA9是胆固醇反应基因。
▼ 基因结构
Piehler et al.(2002)确定ABCA9基因包含39个外显子,跨度约85 kb。第一个外显子是非编码的。
▼ 测绘
Piehler等(2002)通过基因组序列分析,将ABCA9基因定位到染色体17q24.2。它与其他 4 个 ABC 转运蛋白基因聚集在一起,包括 ABCA6 和 ABCA8。