自身免疫性甲状腺疾病中的锌指基因 1；ZFAT1
锌指蛋白 406；ZNF406
HGNC 批准的基因符号：ZFAT
细胞遗传学定位：8q24.22 基因组坐标（GRCh38）：8:134,477,788-134,832,339（来自 NCBI）
▼ 克隆与表达
染色体8q23-q24上对自身免疫性甲状腺疾病易感性狭窄区域内（AITD3; 608175），Shirasawa et al.（2004）通过RACE和RT-PCR从公共数据库延伸表达序列标签（EST）鉴定了ZFAT1基因。最长的预测蛋白质产物由 1,243 个氨基酸和 18 个锌指重复结构域组成。人体组织中的RT-PCR表达分析显示，ZFAT1在胎盘、肾脏、脾脏、睾丸和外周血淋巴细胞中强表达。截短剪接变体（TRZFAT）在胎盘、卵巢和扁桃体中强烈表达。TRZFAT 变体编码具有 11 个锌指重复结构域的 846 个氨基酸的蛋白质。Shirasawa等人（2004）指出，一个小反义转录本（SASZFAT）可能是一种非编码RNA，由939个核苷酸组成。
▼ 基因结构
Shirasawa et al.（2004）确定ZFAT1基因由19个外显子组成。该基因经历了外显子 1、2、3 和 9b 的选择性剪接，由于外显子 9b 中存在终止密码子，截短的转录本 TRZFAT 仅包含 10 个外显子。最长的 ZFAT1 转录本由 16 个外显子组成。小反义转录本 SASZFAT 由外显子 9a 和 9b 的序列组成。
▼ 测绘
Shirasawa et al.（2004）在染色体8q23-q24上的一个狭窄的易患自身免疫性甲状腺疾病的区域内鉴定了ZFAT1基因。
▼ 分子遗传学
Shirasawa等人（2004）通过对500多名自身免疫性甲状腺炎患者和对照者进行连锁和关联分析，发现了单核苷酸多态性（Ex9b-SNP10；Ex9b-SNP10；610931.0001）存在于 ZFAT1 基因中，与染色体 8q24（AITD3；AITD3；608175）。Ex9b-SNP10属于截短的ZFAT1的3-prime非翻译区（TRZFAT）和小反义转录本的启动子区（SASZFAT）。在外周血淋巴细胞中，SASZFAT 仅在 CD19+ B 细胞中表达，SASZFAT 和 TRZFAT 的表达水平似乎分别与 Ex9b-SNP10 T 相关 ZFAT1 等位基因呈负相关和正相关。Shirasawa et al.（2004）得出结论，Ex9b-SNP10在体外关键参与SASZFAT表达的调节，并且该表达导致TRZFAT表达减少。Shirasawa et al.（2004）提出，SNP相关的ZFAT1等位基因可能通过调节SASZFAT的表达来影响TRZFAT的表达水平，从而在B细胞功能中发挥关键作用，并且SNP的这种调节机制可能参与控制易感性或对人类疾病的抵抗力。
▼ 动物模型
Tsunoda et al.（2010）发现Zfat1+/-小鼠具有存活能力、生育能力，并且与野生型小鼠没有区别，而Zfat-/-小鼠则遭受早期胚胎致死。Zfat -/- 胎盘在胚胎第8.0天时显示海绵滋养层发育异常，在胚胎第9.5天时Zfat -/- 卵黄囊无血，血岛数量减少，造血祖细胞分化受损。造血分化缺陷与 Zfat 直接靶标 Tal1（187040）、Lmo2（180385）和 Gata1（305371）以及 Tal1 下游基因表达的显着降低有关。
▼ 等位基因变异体（1个精选示例）：
.0001 自身免疫性甲状腺疾病，易感性，3
ZFAT1、IVS9、AT
Shirasawa et al.（2004）发现ZGAT1基因内含子9的功能性SNP（Ex9b-SNP10）与自身免疫性甲状腺疾病（AITD3）易感性相关。Sakai 等人（2001）对 112 名患有 AITD 的先证者进行了研究（608175），并在 515 名受影响个体和 526 名对照者中证实了这种关联。这两项研究的所有参与者都是日本人。Ex9b-SNP10 的 T 等位基因与 AITD 风险增加相关（主导模型：优势比 = 1.7，p = 0.00009）。Shirasawa et al.（2004）证明ZFAT1的Ex9b-SNP10等位基因影响B细胞中小反义转录本（SASZFAT）和截短剪接变体（TRZFAT）的表达水平，表明Ex9b-SNP10等位基因起着关键作用B 细胞功能，因此可能涉及 AITD 的病因学。
