G-补丁结构域蛋白 8; GPATCH8

KIAA0553

HGNC 批准的基因符号:GPATCH8

细胞遗传学定位:17q21.31 基因组坐标(GRCh38):17:44,395,281-44,503,406(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

通过对从大小分级的脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,Nagase 等人(1998)分离出了部分 GPATCH8 克隆,他们将其命名为 KIAA0553。1,095个氨基酸序列与U2AF1RS2(ZRSR2; 300028)。RT-PCR 在所有检查的组织中检测到不同的 GPATCH8 表达,其中肾脏、胸腺和卵巢中的表达最高,胰腺和脾中的表达最低。

通过在EST数据库中搜索成人和胎儿组织之间差异表达的基因,McKinney等人(2004)鉴定出了KIAA0553。推导的全长蛋白质含有 1,445 个氨基酸。它具有参与 RNA 加工和修饰的结构域、C2H2 型锌指、RGD 基序、核定位信号以及酰胺化、肉豆蔻酰化、脂化、N-糖基化、糖胺聚糖附着和磷酸化位点。数据库分析揭示了一个可能的剪接变体,编码推导的 1,424 个氨基酸的蛋白质。Northern 印迹分析检测到 KIAA0553 在所有检查的成人组织中表达,其中在骨骼肌、大脑、心脏和胰腺中表达显着。在人胎儿心脏中的表达远低于成人心脏中的表达。在多种脊椎动物中检测到了 KIAA0553 的直系同源物,其中 C 端结构域的保守性最高。

Kaneko et al.(2011)指出,GPATCH8 蛋白具有一个 N 端 G-patch 结构域,随后是一个 C2H2 型锌指结构域、一个富含赖氨酸的区域和一个中央富含丝氨酸的区域。

▼ 基因结构

McKinney et al.(2004)确定GPATCH8基因含有6个外显子。

▼ 测绘

Nagase等(1998)通过辐射杂交分析将GPATCH8基因定位到染色体17。McKinney等(2004)指出人类GPATCH8基因定位到染色体17q21.31,而基因Gpatch8基因定位到染色体16A1 。

▼ 分子遗传学

关联待确认

有关 GPATCH8 基因突变作为青少年发病高尿酸血症可能原因的讨论,请参阅 614396.0001。

▼ 等位基因变异体(1个精选示例):

.0001 意义不明的变体

GPATCH8、ALA979PRO

该变异被归类为意义不明的变异,因为其对青少年发病的高尿酸血症的影响尚未得到证实。

Kaneko等(2011)报道了一个日本家庭,其中一位56岁的父亲和他的3个儿子(分别为29岁、26岁和23岁)患有常染色体显性成骨不全症I型(OI1;166200)与高尿酸血症共分离。发现OI是由杂合突变引起的(c.3235G-A;G1079S)位于COL1A1基因(120150)中。Kaneko等人(2011)通过全外显子组测序,在GPATCH8基因的外显子8中发现了杂合的c.2935G-C颠换,预测在高度保守的残基处发生ala979-to-pro(A979P)取代。在300个正常等位基因或dbSNP(build 132)数据库中均未发现该突变。所有 4 名患者均患有约 8 mg/dl 的高尿酸血症,诊断年龄均在 15 至 30 岁之间。1个儿子痛风发作,另外2个儿子患有尿路结石。所有受影响个体的高尿酸血症均通过药物得到良好控制。

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