RHO 鸟嘌呤核苷酸交换因子 40;ARHGEF40
SOLO
FLJ10357
HGNC 批准的基因符号:ARHGEF40
细胞遗传学定位:14q11.2 基因组坐标(GRCh38):14:21,061,264-21,090,248(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Tse等人(2005)使用酵母2-杂交筛选来鉴定与大鼠脑文库中的tau(157140)铰链结构域相互作用的蛋白质,孤立出一种新的cDNA,他们将其命名为SOLO。通过数据库搜索,他们鉴定出了人类和小鼠的同源物。所有 3 个物种的推导蛋白均包含一个 C 端 RhoGEF 结构域,随后是一个连续白细胞 C 分裂底物结构域,以及 3 个与斑马鱼 Quattro 蛋白区域同源的区域,该区域参与肌动蛋白细胞骨架介导的形态发生运动。人类 SOLO 的预测分子量为 165 kD。对成年大鼠和小鼠胚胎组织进行Northern印迹分析,检测到2条mRNA条带,其中一条普遍存在,但在大脑中富集,另一条主要局限于大脑,但在心脏中表达较弱。在胎儿和成人组织中观察到这两种转录本。嗅球和小脑的表达水平最高,并在围产期达到高峰(E16至P0.5)。人体组织的蛋白质印迹分析显示,在中枢神经系统和骨骼肌中的表达量最高,并且在胎儿大脑中的丰度高于成人大脑。在胎儿大脑、成人大脑和骨骼肌中观察到了几种不同大小的信号,其中骨骼肌中的信号更强。使用来自不同人体组织的 mRNA 进行的 RT-PCR 提供了广泛的选择性剪接的证据。人神经母细胞瘤(SY5Y)和小鼠成肌细胞(C2C12)细胞的免疫荧光显微镜检查将SOLO定位于细胞质,细胞核周围信号最强。该信号延伸到 SY5Y 细胞的突起中。SOLO 并未与 tau、α-微管蛋白(参见 602529)或 F-肌动蛋白(参见 102610)完全共定位。
▼ 基因结构
Tse et al.(2005)确定SOLO基因包含25个翻译的外显子并且跨越至少23 kb的基因组DNA。SOLO 基因的外显子 3 作为框,由于该外显子的长度不是三的倍数,因此如果排除它,阅读框会发生变化,导致蛋白质过早终止。外显子 21 也充当框,并且外显子 22a 和 22b 似乎是相互排斥的。
▼ 测绘
通过序列分析,Tse等(2005)将SOLO基因定位到染色体14q11.2。