ATP 结合框，亚科 A，成员 13; ABCA13

HGNC 批准的基因符号：ABCA13

细胞遗传学定位：7p12.3 基因组坐标（GRCh38）：7:48,171,458-48,647,497（来自 NCBI）

▼ 说明

ATP结合框（ABC）转运蛋白超家族的成员进行底物分子的能量依赖性转运。ABCA13属于ABC转运蛋白的一个亚家族，包含2个跨膜（TM）结构域，每个跨膜结构域有大约6个跨膜片段，以及2个位于细胞质的核苷酸结合结构域（NBD）。

▼ 克隆与表达

Prades等人（2002）通过使用保守的ABCA亚家族结构域筛选序列数据库，然后对肺cDNA文库进行3-prime和5-prime RACE，克隆了全长ABCA13。推导的 5,058 个氨基酸的蛋白质包含 N 端信号序列。C 端一半包含 2 组 6 个 TM 螺旋和由高度疏水序列分隔的细胞内 NBD。Prades 等人（2002）检测到 5 个剪接变体，它们编码大小从 2,654 到 4,958 个氨基酸的推导蛋白。这些替代转录物导致替代的 C 末端或大的 N 末端片段（包括信号肽）的丢失。Prades 等人（2002）还预测了由于外显子 17 的选择性剪接而编码推导的 717 个氨基酸的蛋白质的变体。ABCA13 与其他几种 ABCA 转运蛋白具有约 36% 的同一性，其中 2 个 ATP 结合域的同源性最高。RT-PCR 检测到 2 个可变剪接转录物在气管、睾丸和骨髓中表达水平最高。对小鼠组织进行 PCR 分析，检测肾脏和骨骼肌中 Abca13 的表达。作者鉴定了源自小鼠肾脏和视网膜的 EST，其中含有 Abca13。

▼ 基因结构

Prades et al.（2002）确定ABCA13基因包含62个外显子，跨度超过450 kb。外显子 17 和 18 较大，分别包含 4,779 和 1,827 bp。

▼ 测绘

Prades等（2002）通过基因组序列分析，将ABCA13基因定位到染色体7p12.3。利用辐射杂交分析，他们将小鼠 Abca13 基因对应到染色体 11A1 的一个区域，该区域与人类染色体 7p12.3 显示同线性。

▼ 分子遗传学

Knight等人（2009）报道了ABCA13是精神分裂症和双相情感障碍的易感因素的证据。在最初发现精神分裂症患者的染色体异常对其造成破坏后，Knight 等人（2009）对 100 名精神分裂症患者和 100 名对照者的 ABCA13 外显子进行了重新测序。鉴定出多种罕见的编码变异，包括 1 个无义突变和 9 个错义突变以及 6 例复合杂合性/纯合性。在另外 1,600 多个精神分裂症、双相情感障碍、抑郁症病例和 950 多个对照队列中对变异进行了基因分型，所有罕见变异的频率加起来高于精神分裂症和双相情感障碍对照（比值比 = 1.93，P = 0.0057）（比值比 = 2.71，P = 0.00007）。这些突变的人群归因风险对于精神分裂症为 2.2%，对于双相情感障碍为 4.0%。在一项针对 21 个突变携带者家族的研究中，Knight 等人（2009）对受影响和未受影响的亲属进行了基因分型，发现罕见变异与精神分裂症、双相情感障碍和重度抑郁症等表型存在显着关联（lod = 4.3）。Knight 等人（2009）得出的结论是，他们的数据鉴定了一个候选基因（ABCA13），强调了精神分裂症、双向情感障碍和抑郁症之间的遗传重叠，并表明罕见的编码变异可能会显着增加这些疾病的风险。