少突细胞成熟相关长基因间非编码RNA; OLMALINC
长基因间非编码 RNA 263;LINC00263
lincRNA OLMALINC
此条目中代表的其他实体:
包含 OLMALINC 反义 RNA;OLMALINCAS,包含
HGNC 批准的基因符号:OLMALINC
细胞遗传学定位:10q24.31 基因组坐标(GRCh38):10:100,373,576-100,388,354(来自 NCBI)
▼ 说明
长基因间非编码 RNA(LINC),例如 OLMALINC,长度超过 200 个核苷酸,缺乏蛋白质编码能力,并且定位到其他 2 个基因之间的染色体区域。LINCs 一般在基因转录调控中发挥作用(Mills et al., 2015 总结)。
▼ 克隆与表达
Mills等(2015)通过对人类额叶皮层基因表达的整体分析发现,OLMALINC在白质中的表达高于灰质。数据库分析预测了 3 种可能的 OLMALINC 剪接变体,但 RT-PCR 分析和测序表明只有 2 种剪接变体在人类白质中表达。这些转录本的长度分别为 988 和 1,517 个核苷酸。数据库分析表明 OLMALINC 在 16 种人体组织中表达存在差异,其中脑中表达最高,其次是肝脏、卵巢和乳腺。在白细胞、心脏和肾脏中发现表达最低。Mills et al.(2015)还鉴定了一个反义转录本,OLMALINCAS,长度为 488 个核苷酸。该转录本与相反链上 988 个核苷酸的 OLMALINC 转录本的第一个外显子有大量重叠。定量 RT-PCR 检测到人白质中 OLMALINCAS 高表达。
▼ 基因功能
Mills et al.(2015)发现,RNA干扰介导的人类神经元和少突胶质细胞系中OLMALINC表达的沉默改变了100多个基因的表达。这些基因中有大量调节少突胶质细胞的细胞激活和膜信号传导。
▼ 基因结构
Mills et al.(2015)确定OLMALINC基因至少有3个外显子。外显子 2 和侧翼内含子序列进行选择性剪接。OLMALINCAS 位于 OLMALINC 外显子 1 的相反链上,包含单个外显子。
▼ 测绘
Mills等(2015)通过基因组序列分析,将OLMALINC基因定位到染色体10q24.31,位于SCD(604031)和WNT8B(601396)基因之间。OLMALINCAS 对应到相反的链并基本上与 OLMALINC 的第一个外显子重叠。
▼ 进化
通过数据库分析,Mills et al.(2015)发现OLMALINC基因仅存在于类人猿和东大陆猴中。然而,OLMALINC 的启动子区域早在负鼠和鸭嘴兽中就表现出保守性。