PH 结构域内吞转运转换因子 2; PHETA2

具有序列相似性的家族109，成员B；FAM109B
Sesquipedalian，果蝇，2的同源物；SES2
肌醇多磷酸酯磷酸酶相互作用蛋白，27-KD，B；IPIP27B

HGNC 批准的基因符号：PHETA2

细胞遗传学定位：22q13.2 基因组坐标（GRCh38）：22:42,074,248-42,079,438（来自 NCBI）

▼ 说明

FAM109A（PHETA1；614239）和 FAM109B 调节内体运输，并将 OCRL（300535）与内体分类和回收时受体的回收联系起来（Noakes et al., 2011）。

▼ 克隆与表达

Swan等人（2010）通过查阅文献，鉴定出一种果蝇蛋白作为Ocrl的候选相互作用子。他们将果蝇蛋白质命名为 Ses，是 sesquipedalian 的缩写，意思是对简单事物的不必要的长描述。数据库分析揭示了 Ses 从无脊椎动物到人类的保守性。就像无脊椎动物的 Ocrl 基因在脊椎动物中复制产生 OCRL 和 INPP5B（147264）一样，无脊椎动物中的单个 Ses 基因在脊椎动物中复制产生 FAM109A 和 FAM109B，Swan et al.（2010）将其称为 SES1 和 SES2 ， 分别。SES1 和 SES2 的 N 端部分含有一个持续-白细胞 C 中断底物（PLEK; 173570）同源（PH）结构域后面是卷曲螺旋结构域。SES1 和 SES2 不太保守的 C 端部分主要未折叠，包含多个 SRC（190090）同源 3（SH3） 结构域结合 PxxP 基序。转染的 COS-7 细胞的免疫荧光显微镜显示，人 SES1 和 SES2 与人 OCRL 在内体和表达 EEA1（605070）和 WDFY2（610418）的较大囊泡中共定位。

Noakes et al.（2011）报道人类FAM109B蛋白，他们称之为IPIP27B，含有259个氨基酸。转染的人TERT-RPE1细胞的免疫荧光显微镜显示IPIP27B和IPIP27A（FAM109A）定位于循环内体和跨高尔基体网络（TGN）。

▼ 基因功能

Swan et al.（2010）通过在 COS-7 细胞和大鼠脑提取物中进行免疫共沉淀和 Pull-down 实验，发现人 SES1 和 SES2 的 C 末端与 OCRL 和 INPP5B 的 ASH-RhoGAP 样结构域相互作用。突变分析表明，SES 蛋白通过与另一种 OCRL 结合蛋白 APPL1（604299）相似的保守 C 端基序与 OCRL 相互作用。Swan等人（2010）将这个基序称为F&H基序，并发现保守的苯丙氨酸对于OCRL结合至关重要。在小鼠大脑提取物和转染的 COS-7 细胞中进行的 Pull-down 实验表明，OPRL 中的错义突变破坏了 Lowe 综合征（309000）或 Dent 疾病-2（300555）患者与 APPL1 的结合，也消除了 OCRL 与 SES1 的结合， SES2。此外，APPL1 和 SES 蛋白不能同时结合 OCRL。共聚焦显微镜表明 APPL1 和 SES 蛋白依次与内体相关，并且 SES 蛋白定位于磷脂酰肌醇 3-磷酸阳性囊泡。Swan等人（2010）提出Lowe综合征和Dent病2是由内吞途径内多个位点的扰动引起的。

通过酵母2-杂交分析、pull-down实验和HeLa细胞中的天然共免疫沉淀实验，Noakes等人（2011）证实IPIP27A和IPIP27B的C端与OCRL1和OCRL1的C端ASH和RhoGAP样结构域结合。 INPP5B。IPIP27A和IPIP27B也形成同源二聚体和异源二聚体。与Swan等人（2010）的结果类似，Noakes等人（2011）发现与Lowe综合征相关的OCRL1突变消除了与IPIP27A和IPIP27B的相互作用。HeLa 细胞中通过 RNA 干扰消除 IPIP27A 和/或 IPIP27B 导致早期内体增大，破坏转铁蛋白受体（TFRC；190010），损害了CIMPR（IGF2R；147280）从内体转移到TGN，并引起溶酶体水解酶的错配。Noakes et al.（2011）提出IPIP27A和IPIP27B是内吞运输的关键参与者，这一过程的缺陷是导致Lowe综合征和Dent病2的病理学原因。

▼ 测绘

Gross（2011）根据FAM109B序列（GenBank BC104176）与基因组序列（GRCh37）的比对，将FAM109B基因定位到染色体22q13.2。