角蛋白 6A,II 型;KRT6A
角蛋白,表皮类型 II,K6A;K6A
KB6
HGNC 批准的基因符号:KRT6A
细胞遗传学定位:12q13.13 基因组坐标(GRCh38):12:52,487,176-52,493,257(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
角蛋白6A(K6A)是主要的K6亚型。Takahashi等人(1995)用源自K6B基因(148042)的探针筛选了人类基因组和皮肤cDNA文库,并分离出含有全长基因和预测编码K6a的cDNA的克隆。鉴定出多达 6 种不同的人类 K6 蛋白亚型,它们在基因结构、核苷酸序列和预测的氨基酸序列水平上高度相关。Takahashi et al.(1995)提出了一种进化模型,其中人类K6基因的多样性是通过连续的基因复制事件来解释的。他们证实,K6A 显然是皮肤组织样本和培养的上皮细胞系中占主导地位的 K6 同工型,并且各种同工型在上皮组织类型内部和之间受到差异性调节。
▼ 基因结构
Tyner 等人(1985)提供了有关 II 型角蛋白基因结构的信息。基本角蛋白基因家族最近的一次重复产生了人类 K6 基因的 2 个拷贝。其中一个拷贝的表达水平非常低,并且在成为传统假基因的过程中可能还处于尚未结束的阶段。
Takahashi et al.(1995)确定KRT6A基因含有9个外显子。
▼ 测绘
Rosenberg et al.(1991)通过体细胞杂交体的Southern印迹分析将KRT6A基因分配给染色体12。通过中期染色体的原位杂交,他们证明KRT6A基因位于12q12-q14区域。
▼ 分子遗传学
在斯洛文尼亚一个家庭的受影响成员中,孤立出先天性厚甲症,描述为 Jadassohn-Lewandowsky 型(PC3;615726),Bowden et al.(1995)鉴定出KRT6A基因(148041.0001)突变的杂合性。
Terrinoni et al.(2001)在先天性厚甲症患者的 KRT6A 基因中发现了 3 个新的突变(148041.0002-148041.0004)和 2 个先前发现的突变(参见例如 148041.0001)。
Smith等人(2005)在国际先天性厚甲症研究登记处的30名先证者中鉴定出角蛋白突变,其中17人的KRT6A基因发生突变(参见例如148041.0001和148041.0005-148041.0008)。
Du等人(2012)在一名患有先天性厚甲症的32岁中国女性中鉴定出KRT6A基因剪接位点突变(148041.0009)的杂合性。她 7 岁的女儿只有局灶性足底角化过度,没有指甲或手部受累,她也是该突变的杂合子。
Wilson等人(2014)在一名散发性PC3患者中鉴定出KRT6A基因杂合无义突变(E461X;148041.0010)。
▼ 动物模型
Wong等(2000)发现K6缺失小鼠的口腔粘膜出现类似于先天性厚甲症的变化。他们推测为什么小鼠的指甲形态没有明显的改变,这是先天性厚甲症的显着特征。
Wojcik et al.(2001)培育了缺乏 K6a 和 K6b 的小鼠。大多数 K6a/K6b 双无效小鼠在生命的前两周内死于饥饿。饥饿是由于舌背上皮局部崩解,导致细胞碎片斑块的堆积,严重影响进食。然而,大约 25% 的 K6a/K6b 双无效小鼠存活至成年,并具有正常的毛发和指甲。Wojcik等人(2001)鉴定了在毛囊中表达的第三个K6基因K6hf(609025),并提出它的存在为K6a/K6b双无效小鼠中不存在毛发和指甲缺陷提供了解释。
▼ 等位基因变异体(10个精选例子):
.0001 先天性厚甲症 3
KRT6A、3-BP DEL、516CAA
Wilson et al.(2014)将该突变称为c.516_518delCAA(Asn172del)。
Bowden等(1995)在一个斯洛文尼亚家庭中观察到Jadassohn-Lewandowsky型先天性厚甲症(PC3; 615726)在祖父、父亲和女儿中。父女俩都有典型的变化:指甲增厚、掌跖角化症、舌白角化症。祖父只有轻微的指甲变化和轻度角化病(增加了体细胞和生发嵌合体的可能性)。在其他先天性厚甲症患者中已发现突变的KRT16和KRT17中未发现突变。他们鉴定出K6A基因外显子1中3-bp缺失(AAC)的杂合性,该缺失从1A螺旋结构域的第8位(Asn8del)去除了高度保守的天冬酰胺残基。该突变以杂合状态存在。
Terrinoni等(2001)在1例家族性和2例散发性PC病例中发现了这种突变,并将其命名为N171del(Asn171del)。在2例白色海绵痣病例中报道了KRT4基因的类似突变(123940.0001)(Rugg et al., 1995)。该突变与多个 II 型角蛋白基因(包括 KRT4 和 KRT6A)的外显子 1 中存在的 3 个串联 CAA 重复复制过程中的 DNA 聚合酶滑移一致。
Smith等人(2005)在3例家族性和3例散发性先天性厚甲症病例中鉴定出KRT6A基因中Asn171del突变的杂合性。
.0002 先天性厚甲症 3
KRT6A、PHE174VAL
散发性先天性厚甲症患者(PC3;615726),Terrinoni et al.(2001)在KRT6A基因中发现了c.520T-G颠换,导致phe174-to-val(F174V)氨基酸取代。该突变是蛋白质 1A 结构域中的 F10V。
.0003 先天性厚甲症 3
KRT6A、GLU472LYS
散发性PC患者(PC3; 615726),Terrinoni et al.(2001)鉴定了 KRT6A 基因中的 c.1414G-to-A 转变,导致 glu472-to-lys(E472K)氨基酸取代。该突变是蛋白质 2B 结构域中的 E117K。
.0004 先天性厚甲症 3
KRT6A、LEU469ARG
散发性PC患者(PC3; 615726),Terrinoni 等人(2001)报道了 KRT6A 基因中的 c.1406T-G 颠换,导致 leu469 到 arg(L469R)氨基酸取代。该突变是蛋白质 2B 结构域中的 L114R。
.0005 先天性厚甲症 3
KRT6A、LEU469PRO
散发性先天性厚甲症患者(PC3;615726),Smith et al.(2005)鉴定了KRT6A基因中c.1406T-C转变的杂合性,导致2B结构域的高度保守的螺旋终止基序中由leu469到pro(L469P)的取代。
.0006 先天性厚甲症 3
KRT6A、ASN171SER
散发性先天性厚甲症患者(PC3;615726),Smith et al.(2005)鉴定了KRT6A基因中c.512A-G转变的杂合性,导致1A结构域的高度保守的螺旋起始基序中由asn171到ser(N171S)取代。
.0007 先天性厚甲症 3
KRT6A、ASN171LYS
患有先天性厚甲症家族的患者(PC3;615726),Smith et al.(2005)鉴定出KRT6A基因中c.513C-A颠换的杂合性,导致1A结构域高度保守的螺旋起始基序中asn171-to-lys(N171K)取代。
.0008 先天性厚甲症 3
KRT6A、PHE174SER
2例散发性先天性厚甲症(PC3;615726),Smith et al.(2005)鉴定了KRT6A基因中c.521T-C转变的杂合性,导致1A结构域的高度保守的螺旋起始基序中由phe174到ser(F174S)的取代。
.0009 先天性厚甲症 3
KRT6A、IVS8AS、交流、-2
一名患有先天性厚甲症的 32 岁中国女性(PC3; 615726),Du et al.(2012)鉴定出KRT6A基因(IVS8-2A-C)内含子8-2位置的A-C颠换杂合性,导致11-bp缺失(c.1460_1470del) )位于外显子 9 的开头,由于下游剪接受体位点的激活。预计该删除会导致移码,从而产生提前终止密码子(Ser487PhefsTer72)。先证者有趾甲增厚、足底角化过度伴开裂、轻度局灶性掌角化过度,但指甲无变化;她还表现出口腔白角化症、嘴唇干裂和舌头干裂。她 7 岁的女儿也是剪接位点突变杂合子,患有局灶性足底角化过度、舌裂和牙龈炎,但没有指甲或手受累。两名患者均报告手脚多汗症。
.0010 先天性厚甲症 3
KRT6A、GLU461TER
散发性先天性厚甲症3型(PC3; 615726),Wilson et al.(2014)在KRT6A基因中发现了一个杂合的c.1381G-T颠换,导致2B结构域中螺旋终止基序的起始处发生glu461-to-stop(E461X)替换,并且缺乏螺旋终止基序和尾部结构域的蛋白质。