HIF1A 反义 RNA 2; HIF1AAS2

反义HIF1-α; AHIF
反义 HIF1-α, 3-PRIME
AHIFIA, 3-PRIME

HGNC 批准的基因符号:HIF1A-AS2

细胞遗传学定位:14q23.2 基因组坐标(GRCh38):14:61,747,039-61,749,089(来自 NCBI)

▼ 说明

长非编码RNA,例如HIF1AAS2,参与多种过程,包括染色质修饰、转录调节、RNA结合蛋白的募集以及mRNA成熟的调节(Bertozzi et al., 2011)。

▼ 克隆与表达

利用差异显示技术鉴定非乳头状透明细胞肾癌(144700)与正常肾脏相比表达上调的基因,随后通过5-prime RACE,Thrash-Bingham和Tartof(1999)克隆了HIF1AAS2,他们将其称为AHIF。AHIF 含有至少 1,577 个核苷酸,富含 AU,不含 ORF,并且缺少 5 素帽和聚(A)尾。AHIF的3-引物882个核苷酸与HIF1A(603348)的3-引物UTR完全互补,其转录方向相反。

▼ 基因功能

Thrash-Bingham and Tartof(1999)发现,与正常组织相比,AHIF在所有研究的非乳头状癌中均过表达,而HIF1A和β-肌动蛋白(ACTB;102630)控制保持相对稳定。AHIF 在非乳头状肾癌细胞系中高表达,并且对氧张力不敏感。然而,在淋巴细胞系中,AHIF 表达因缺氧而上调,同时 HIF1A mRNA 减少。

Baranello et al.(2010)表明抗癌剂喜树碱可以抑制DNA拓扑异构酶I(TOP1;126420),反义转录本5-prime AHIF1A(HIF1AAS1; 614528)和3-prime AHIF1A,并降低了人类细胞系中初级HIF1A转录物的表达。

Bertozzi等人(2011)发现喜树碱对5-prime AHIF1A和3-prime AHIF1A表达的影响是细胞系特异性的,因为在HeLa细胞中喜树碱处理后3-prime AHIF1A没有上调。用药理学缺氧模拟物处理 HCT116 细胞诱导 3-prime AHIF1A 表达,但不诱导 5-prime AHIF1A 表达。定性 RT-PCR 检测到肾癌中 5-prime AHIF1A 和 3-prime AHIF1A 的上调。

▼ 测绘

Thrash-Bingham and Tartof(1999)确定HIF1AAS2基因位于相反方向,并且与染色体14q23.2上HIF1A基因的3-prime UTR重叠。

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