NIPA 样结构域蛋白 4; NIPAL4

ICHTHYIN; ICHYN

HGNC 批准的基因符号:NIPAL4

细胞遗传学定位:5q33.3 基因组坐标(GRCh38):5:157,460,213-157,474,722(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Lefevre等人(2004)通过计算机分析克隆了NIPAL4,他们将其命名为鱼毒素。推导的 404 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 44 kD。该蛋白具有几个假定的跨膜结构域,并且与小鼠和大鼠直系同源物具有大约 75% 的序列同一性。预计它位于质膜中,但不具有信号序列。RT-PCR 检测到脑、肺、胃、皮肤和白细胞以及除肝、甲状腺和胎儿脑外未检测到表达的所有其他测试组织中鱼鳞酸高水平表达。在正常皮肤活检培养的角质形成细胞中观察到强表达;在来自相同皮肤活检的培养成纤维细胞、胎盘和淋巴细胞中表达较弱。

▼ 基因结构

Lefevre et al.(2004)确定NIPAL4基因含有6个外显子。

▼ 测绘

Lefevre等人(2004)通过计算机和序列分析将NIPAL4基因定位到染色体5q33。

▼ 分子遗传学

来自14个近亲家庭的23名非综合征型常染色体隐性先天性鱼鳞病患者(ARCI6;612281),Lefevre et al.(2004)鉴定了NIPAL4基因中的6个纯合突变(参见例如609383.0001-609383.0002)。

Dahlqvist 等人(2007)研究了来自 18 个 ARCI 家族的 27 名患者,这些患者的表皮具有特定的超微结构特征,电镜分析的鱼鳞病被指定为 III 型(EM type III)。NIPAL4突变筛查显示,18个家族中的16个(89%)家系中受影响的成员中有4种不同的错义或剪接位点突变(参见例如609383.0003-609383.0004),这些家族具有ARCI EM III型的这些特征。

▼ 等位基因变异体(4个精选例子):

.0001 鱼鳞病,先天性,常染色体隐性遗传 6

NIPAL4、ARG83TER

阿尔及利亚 3 个近亲家庭成员患有常染色体隐性遗传性先天性鱼鳞病-6(ARCI6;Lefevre et al.(2004)在 NIPAL4 基因的外显子 2 中发现了一个纯合的 247C-T 转变,导致 arg83 到 ter(R83X)的取代(见 612281)。

.0002 鱼鳞病,先天性,常染色体隐性遗传 6

NIPAL4、ALA114ASN

Lefevre等人(2004)在7个患有常染色体隐性先天性鱼鳞病-6(612281)的近亲血缘家庭的受影响成员中,在NIPAL4基因的外显子4中发现了纯合的341C-A颠换,导致ala114-to-asn(A114N) ) 代换。其中1个家庭来自哥伦比亚,3个家庭来自土耳其,3个家庭来自阿尔及利亚。

.0003 鱼鳞病,先天性,常染色体隐性遗传 6

NIPAL4、ALA176ASP

Dahlqvist 在一项对来自 18 个家系的 27 例常染色体隐性先天性鱼鳞病-6(612281)患者的研究中,电镜(EM)特征为 III 型(ARCI EM type III),颗粒层和核周层状体异常,膜拉长,Dahlqvist et al.(2007)在NIPAL4 cDNA的外显子4中发现了527C到A的颠换,导致ala176到asp(A176D)氨基酸取代。在检查的 54 个等位基因中,有 37 个发现了突变。

.0004 鱼鳞病,先天性,常染色体隐性遗传 6

NIPAL4、IVS5、GA、+1

Dahlqvist 等人(2007)在一例常染色体隐性遗传性先天性鱼鳞病-6(612281)患者中鉴定出 NIPAL4 基因外显子 5 剪接供体位点 G-to-A 转变的复合杂合性,以及 A176D 突变( 609383.0003)。DNA测序表明,突变体mRNA通过激活隐秘剪接位点保留了68个核苷酸的内含子序列,从而导致提前终止密码子。

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