死框解旋酶 10;DDX10

DEAD/H框 10

此条目中代表的其他实体:

包含 DDX10/NUP98 融合基因

HGNC 批准的基因符号:DDX10

细胞遗传学定位:11q22.3 基因组坐标(GRCh38):11:108,665,069-108,940,927(来自 NCBI)

▼ 说明

DEADbox RNA解旋酶家族的成员,例如DDX10,具有特征性的asp-glu-ala-asp(DEAD)框,作为8个高度保守的序列基序之一。通过改变 RNA 二级结构,这些蛋白质可以影响转录起始、剪接以及核糖体和剪接体组装(Savitsky 等人总结,1996)。

▼ 克隆与表达

通过在11q22-q23候选区域内定位克隆共济失调毛细血管扩张症(AT; 208900),Savitsky 等人(1996)鉴定了一种推定的 RNA 解旋酶 DDX10,编码推导的 875 个氨基酸的蛋白质,具有 DEAD box 蛋白质序列基序。其序列与其他 DEAD box 蛋白的比较显示出与核糖体组装中涉及的序列最大的相似性。对几种人体组织的 Northern 印迹分析检测到 3.2 kb 转录物的普遍表达,其中在睾丸中表达最高。

▼ 测绘

Savitsky 等人(1996)通过对代表所有染色体 11 和 11q22-q23 区域的体细胞和辐射混合作图面板的分析,证实了 DDX10 定位于染色体 11q22-q23。他们还在染色体 9q21-q22 上发现了一个 DDX10 假基因。

▼ 细胞遗传学

Arai等人(1997)表明,复发性染色体异常inv(11)(p15q22)与新发和治疗相关的骨髓恶性肿瘤相关,导致核孔蛋白基因NUP98(601021)与DDX10融合。在DDX10和NUP98中,inv(11)断点发生在每个基因的2个内含子内,并且这2个基因框内合并以产生该易位特征的嵌合转录本。尽管预测了 2 个相互嵌合产物 NUP98-DDX10 和 DDX10-NUP98,但只有 NUP98-DDX10 似乎与肿瘤发生有关。DDX10 参与核糖体组装,NUP98 是一种核孔复合蛋白,也是急性髓性白血病中发现的其他染色体易位的靶标(参见 601626)。Arai等人(1997)预测NUP98-DDX10融合蛋白可能通过mRNA的异常核质转运或核糖体组装的改变促进白血病发生。

▼ 分子遗传学

Savitsky et al.(1996)发现AT患者的DDX10基因没有突变。然而,对 312 个 AT 和非 AT 染色体的分析揭示了罕见的三核苷酸重复长度多态性。该等位基因包含 10 个而不是正常的 8 个 GAT(天冬氨酸)重复,频率约为 60 个染色体中就有 1 个。

Tags: none