序列相似度90的家族,成员A10; FAM90A10
FAM90A 副本 19
HGNC 批准的基因符号:FAM90A10
细胞遗传学定位:8p23.1 基因组坐标(GRCh38):8:7,768,977-7,771,988(来自 NCBI)
▼ 说明
FAM90A10属于灵长类特有的FAM90A基因家族的II亚家族,起源于多次重复和重排(Bosch et al., 2007)。有关FAM90A基因家族的背景信息以及FAM90A基因进化的信息,请参见FAM90A1(613041)。
▼ 克隆与表达
通过对人类基因组序列(build 36.1)的分析,Bosch et al.(2007)在染色体12p上鉴定出了FAM90A1基因,在染色体8p上鉴定出了另外24个FAM90A基因和假基因,包括FAM90A10。Bosch et al.(2007)将FAM90A10称为FAM90A copy 19。推导的434个氨基酸的FAM90A10蛋白含有CCHC型锌指基序,表明它可能与RNA或DNA相互作用。使用不区分各个 FAM90A 基因的引物进行的 RT-PCR 表明,FAM90A 亚家族 II 的成员(例如 FAM90A10)普遍表达。
▼ 基因结构
Bosch et al.(2007)确定FAM90A10基因含有5个外显子。外显子 1 是非编码的,包含 LINE 元件 L1MB3,最后一个外显子的序列 3-prime 包含 ERV-K 家族的长末端重复序列。与 FAM90A 亚家族 II 的其他成员一样,FAM90A10 在其 5 素末端缺乏重复序列。
▼ 测绘
通过对基因组序列(build 36.1)的分析,Bosch et al.(2007)将FAM90A10基因定位到染色体8p23.1(坐标7661166至7667482)。它是第十九个 FAM90A 拷贝,从远端到近端计数,位于 FAM90A 重复区域内,位于 C 簇内,其中还包括 FAM90A14(613050)、FAM90A18(613052)、FAM90A16、FAM90A8(613045)、FAM90A17、FAM90A19(613053)、和FAM90A9(613046)。簇 C 中的 FAM90A 拷贝在正链上从头到尾定向。