BTAF1 RNA 聚合酶 II,B-TFIID 转录因子相关,170-KD;BTAF1
TATA框结合蛋白相关因子,RNA聚合酶II,170-KD
TAFII170
TAF172
MOT1,酵母,同源物
HGNC 批准的基因符号:BTAF1
细胞遗传学定位:10q23.32 基因组坐标(GRCh38):10:91,923,770-92,031,437(来自 NCBI)
▼ 说明
RNA聚合酶II的转录起始需要TATA框结合蛋白(TBP; 600075)和TBP相关因子,或TAF(例如TAF2B;604912),两种不同的复合物,TFIID 和 B-TFIID。TFIID复合物由TBP和超过8个TAF组成。然而,大部分TBP存在于B-TFIID复合物中,该复合物由TBP和TAFII170(也称为TAF172)组成,并且具有DNA依赖性ATP酶活性。
▼ 克隆与表达
van der Knaap 等人通过使用与酵母转录因子 Mot1 C 端区域同源的 EST 作为探针筛选 B 细胞 cDNA 文库,然后使用 HeLa 细胞 mRNA 进行 RT-PCR 并分离基因组片段al.(1997)获得了编码TAFII170的cDNA。共分级和共沉淀实验表明TAFII170 cDNA编码的蛋白是B-TFIID的TAF子单元。序列分析预测,1,849 个氨基酸的 TAFII170 蛋白含有 7 个具有 ATP 酶活性的蛋白特征特征。TAFII170 的 ATP 酶区域与酵母 Mot1 具有 62% 的氨基酸同一性。之前的分析表明 TAFII170 在 170 至 172 kD 处迁移,van der Knaap 等人(1997)发现 TAFII170 迁移更接近其计算的分子量 206 kD。免疫印迹分析表明重组TAF170可以与重组TBP结合。
Chicca et al.(1998)通过纯化TAF172的微序列分析和PCR,获得了编码TAF172的cDNA,其与酵母Mot1有37%的氨基酸同一性和50%的相似性。
▼ 基因功能
Chicca等人(1998)利用蛋白质印迹分析确定TBP和TAF172的稳定结合需要DNA的存在。电泳迁移率变动分析表明,TAF172 具有 DNA 依赖性 ATP 酶活性,可驱动 TBP 从 DNA 解离,从而释放 TBP 与其他 TATA 框或无 TATA 启动子结合。
▼ 基因结构
van der Knaap等(2000)通过基因组克隆分析确定TAFII170基因全长约130 kb,包含37个内含子。
▼ 测绘
van der Knaap等(2000)通过FISH和放射杂交分析,将BTAF1(TAFII170)基因定位到染色体10q22-q23。