涂层蛋白复合物,子单元 β 1; COPB1

辅酶蛋白复合物,β子单元; COPB
β外壳蛋白

HGNC 批准的基因符号:COPB1

细胞遗传学定位:11p15.2 基因组坐标(GRCh38):11:14,457,512-14,499,811(来自 NCBI)

▼ 说明

高尔基复合体是新合成蛋白质加工和分类的关键细胞器。从内质网(ER)到高尔基复合体以及从高尔基复合体到不同最终细胞目的地的膜运输被认为是由载体囊泡介导的(Palade,1975)。β-COP 参与内质网和高尔基复合体之间的蛋白质转运(Duden 等人总结,1991)。

▼ 克隆与表达

Duden等人(1991)克隆了大鼠肝脏高尔基复合体相关的110-kD蛋白,他们将其称为β-Cop(外壳蛋白)。它是一种外周高尔基体膜蛋白,与 β-adaptin(600157)具有显着同源性。它以膜结合形式和 13-14S 胞质复合物形式存在。

Benichou等人(1994)确定人和大鼠β-COP C端结构域的氨基酸序列保守性超过95%。通过Northern印迹分析,他们发现人类β-COP以3.2-kb mRNA的形式表达。

▼ 基因功能

Benichou等人(1994)利用酵母2-杂交系统发现人β-COP的C末端区域与HIV-1 Nef蛋白相互作用。

▼ 分子遗传学

来自2个无血缘关系的近亲家庭的6名女孩患有Baralle-Macken综合征(BA​​RMACS;Macken et al.(2021)在COPB1基因中发现了2种不同的纯合突变,即剪接位点突变(600959.0001和错义600959.0002)突变。这些突变是通过全外显子组或全基因组测序发现的,与家族中的疾病分开。这两者都不存在于 gnomAD 数据库中。突变的体外功能研究表明,这些变异是亚等位性的。

▼ 动物模型

Macken 等人(2021)发现,CRISPR/Cas9 介导的 X.tropicalis 中 copb1 基因的破坏导致突变动物出现小头畸形、白内障和偶尔的无眼症。一些动物表现出轻微的前脑异常。

▼ 等位基因变异体(2个精选例子):

.0001 巴拉勒-马肯综合症

COPB1、IVS7DS、GT、+1

两名十几岁的姐妹,由近亲波兰罗姆人父母所生,患有巴拉勒-马肯综合征(BA​​RMACS;Macken et al.(2021)在COPB1基因第8外显子剪接供体位点+1位点发现了纯合子G-to-T颠换(c.957+1G-T, NM_016451.4)。619255)。该突变是通过全外显子组测序发现的,与家族中的疾病分离。它不存在于 gnomAD 数据库中。对患者细胞的 PCR 分析表明,该突变产生了 2 个突变转录本:一个跳过了外显子 8 并导致 36 个残基的框内删除,另一个包括外显子 8 并删除了 1-bp 的 c.958G,从而导致下游 18 bp 提前终止。突变转录本似乎逃脱了无义介导的 mRNA 衰变。

.0002 巴拉勒-马肯综合症

COPB1、PHE551VAL

沙特近亲家庭(家庭2)的4名女性成员患有巴拉勒-马肯综合征(BA​​RMACS;619255),Macken et al.(2021)在COPB1基因的外显子14中鉴定出纯合的c.1651T-G颠换(c.1651T-G, NM_016451.4),导致phe551-to-val(F551V)替换β-COP 主干结构域中高度保守的残基。通过全基因组测序发现的这种突变与该家族中的疾病分离。它不存在于 gnomAD 数据库中。分子模型表明该突变可能损害 β-COP 的结构完整性。将突变转染至 HEK293 细胞中导致突变蛋白水平轻度下降,表明不稳定。与野生型相比,将突变转染到视网膜 RPE 细胞中显示出突变蛋白的弥漫性定位,这在高尔基体中以明确的模式出现。作者得出的结论是,这些发现代表了高尔基体到内质网内体循环的缺陷,突变型 β-COP 异常保留在高尔基体中。
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