GATA 锌指结构域蛋白 1; GATAD1

眼睛发育相关基因;ODAG

HGNC 批准的基因符号:GATAD1

细胞遗传学定位:7q21.2 基因组坐标(GRCh38):7:92,447,482-92,495,769(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Tsuruga等人(2002)克隆了小鼠Gatad1,他们将其称为Odag,并通过数据库分析鉴定了人类GATAD1。推导的小鼠蛋白质和人类蛋白质分别含有 266 和 269 个氨基酸。两种蛋白质都有一个 N 末端锌指,并且它们具有 92% 的同一性。Northern blot分析检测到所有小鼠组织中都有2.5 kb Gatad1转录物的表达,其中睾丸和肺中的表达水平最高。发育中小鼠眼的 RT-PCR 显示,从胚胎第 13 天(最早检测的一天)到出生后第 6 天,Gatad1 高表达。表达在出生后第 10 天减少,到出生后第 14 天消失。小鼠眼的原位杂交显示 Gatad1出生后第 2 天和第 7 天在晶状体、睫状体、视网膜、巩膜和结膜中表达。出生后第 7 天视网膜在内核层、外丛状层和外核层中显示 Gatad1 表达。出生后第 14 天,视网膜中未观察到表达,表明 GATAD1 在发育过程中特异性发挥作用。

Theis et al.(2011)利用健康左心室组织的免疫组织化学方法证明了 GATAD1 以均匀的条纹染色模式定位于细胞核和细胞质。

▼ 基因结构

Tsuruga et al.(2002)确定GATAD1基因包含5个编码外显子,跨度约9 kb。

▼ 测绘

Hartz(2012)根据GATAD1序列(GenBank AK26142)与基因组序列(GRCh37)的比对,将GATAD1基因定位到染色体7q21.2。

▼ 分子遗传学

在来自挪威血统近亲家庭的 3 名受影响的同胞中,孤立出常染色体隐性遗传扩张型心肌病,对应到染色体 7q21(CMD2B;614672),Theis et al.(2011)鉴定出GATAD1基因(614518.0001)错义突变的纯合性。对另外 273 名 CMD 先证者的 GATAD1 筛查未发现任何突变。

▼ 等位基因变异体(1个精选示例):

.0001 扩张型心肌病,2B(1 个家族)

GATAD1、SER102PRO

挪威血统近亲家庭的 3 名患病同胞患有常染色体隐性遗传扩张型心肌病(CMD2B;614672),Theis et al.(2011)鉴定了GATAD1基因外显子2中304T-C转变的纯合性,导致保守残基处的ser102到pro(S102P)取代。他们的 6 名未受影响的同胞对于野生型 GATAD1 等位基因是杂合子或纯合子,并且在 474 名具有相似血统且超声心动图正常的对照中未发现该突变。对先证者心脏活检组织的免疫组织化学分析显示,与对照组相比,GATAD1 的核外分布存在明显紊乱。此外,先证者的肌细胞核具有独特的球状形态,与对照组观察到的细长纺锤形形成对比。

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