ZEB1 反义 RNA 1,非编码;ZEB1AS1

长非编码 RNA ZEB1AS1
长链非编码RNA ZEB1AS1

HGNC 批准的基因符号:ZEB1-AS1

细胞遗传学定位:10p11.22 基因组坐标(GRCh38):10:31,307,717-31,320,447(来自 NCBI)

▼ 说明

ZEB1AS1是一种长链非编码RNA(lncRNA),似乎在调节转录因子ZEB1(189909)的表达中发挥作用(Li et al., 2016)。

▼ 克隆与表达

通过微阵列分析识别肝细胞癌(HCC;114550),随后通过5-prime和3-prime RACE,Li et al.(2016)克隆了ZEB1AS1。2,449 个核苷酸的转录本没有编码潜力。FISH 分析检测到 ZEB1AS1 主要存在于细胞核中。

▼ 基因功能

Li等人(2016)利用定量RT-PCR发现,与配对的正常组织相比,ZEB1AS1在HCC中表达上调。在有微血管侵犯的 HCC 患者中,比没有微血管侵犯的患者更容易观察到异常的 ZEB1AS1 表达。启动子低甲基化与ZEB1AS1 过度表达相关。ZEB1AS1 的过度表达增加了 HCC 细胞系的增殖、迁移和侵袭活性,并诱导上皮间质转化的标志物。ZEB1AS1 增加了裸鼠的肿瘤生长和转移。Western blot分析显示ZEB1AS1的过表达增加了ZEB1的表达。ZEB1AS1 上调 ZEB1 报告基因的表达,表明 ZEB1AS1 增加了 ZEB1 启动子活性。ZEB1 的敲低部分逆转了 ZEB1AS1 诱导的 HCC 细胞侵袭。

▼ 基因结构

Li等人(2016)发现了一个与ZEB1AS1和ZEB1基因的启动子区域重叠的CpG岛。

▼ 测绘

Hartz(2016)根据ZEB1AS1序列(GenBank AK026657)与基因组序列(GRCh38)的比对,将ZEB1AS1基因定位到染色体10p11.22。

Li等人(2016)表明ZEB1AS1和ZEB1基因处于接近的头对头方向。

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