内质网-高尔基中间室蛋白 1;ERGIC1

内质网-高尔基中间室蛋白,32-KD;ERGIC32
KIAA1181

HGNC 批准的基因符号:ERGIC1

细胞遗传学定位:5q35.1 基因组坐标(GRCh38):5:172,834,251-172,952,683(来自 NCBI)

▼ 说明

ERGIC1是内质网(ER)和高尔基体中的膜结合蛋白,其功能是稳定ERGIC2(612236)/ERGIC3(616971)复合物(Breuza et al., 2004)。

▼ 克隆与表达

Breuza等人(2004)通过用布雷菲德菌素A(BFA)处理HepG2细胞,导致循环蛋白在ER-高尔基体中间室(ERGIC)中积累,随后进行质谱分析,鉴定出了ERGIC1,他们将其称为ERGIC32。推导的 290 个氨基酸的 ERGIC1 蛋白的计算分子量为 32.5 kD。ERGIC1 与其直系同源物 小鼠和线虫分别具有 98% 和 55% 的氨基酸同一性。它还与人ERGIC3(616971)和ERGIC2(612236)分别具有34%和21%的氨基酸同一性。ERGIC1 与 ERGIC2 和 ERGIC3 一样,在其 N 端和 C 端含有假定的跨膜结构域,但它缺乏 N 端信号序列。糖苷内切酶、碳酸盐和洋地黄皂苷处理表明,ERGIC1 是 N-糖基化的并与膜结合,其末端位于细胞质中,蛋白体位于管腔中。EST 数据库分析表明人类 ERGIC1 普遍表达。BFA 处理后,ERGIC1 定位于早期分泌途径(ER-高尔基体),并与 ERGIC 循环蛋白 KDELR(参见 131235)共定位。免疫荧光显示ERGIC1与ERGIC2和ERGIC3在顺式高尔基体中共定位,但在外周ERGIC中也只发现ERGIC1。

▼ 基因功能

Breuza等人(2004)通过对交联的HepG2细胞进行免疫沉淀分析表明,与ERGIC2一样,ERGIC1与ERGIC3相互作用。在仅用 ERGIC3 转染并用 BFA 处理的细胞中,ERGIC3 在 ER 中积累。然而,当ERGIC1与ERGIC3共转染时,BFA处理后ERGIC1和ERGIC3都在高尔基体中积累。通过RNA干扰沉默ERGIC1或ERGIC2会缩短ERGIC3的半衰期,而沉默ERGIC2或ERGIC3对ERGIC1的表达没有影响,表明ERGIC1稳定了ERGIC2-ERGIC3复合物。同时消耗 ERGIC1 和 ERGIC3 并不影响蛋白质分泌,表明这些蛋白质对于囊泡运输不是必需的。

▼ 基因结构

Breuza等人(2004)指出ERGIC1基因包含10个外显子。

▼ 测绘

Breuza et al.(2004)指出ERGIC1基因定位于染色体5q35.2。

▼ 分子遗传学

在高度近亲阿拉伯亲属的受累成员中(Lebenthal et al., 1970)患有神经源性先天性多发性关节弯曲症(AMC2;208100),Reinstein et al.(2018)在ERGIC1基因中发现了一个纯合错义突变(V98E;617946.0001)。该突变是通过外显子组测序发现的,与该疾病在亲属中分离,并且在 ExAC 数据库或 212 个种族匹配的对照中未发现。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。

▼ 等位基因变异体(1个精选示例):

.0001 先天性多发性关节挛缩 2,神经源性类型(1 个家族)

ERGIC1、VAL98GLU

在高度近亲阿拉伯亲属的受影响成员中(Lebenthal et al., 1970)患有神经源性多发性先天性关节弯曲症-2(AMC2; 208100),Reinstein et al.(2018)在ERGIC1基因中鉴定出纯合的c.293T-A颠换(c.293T-A, NM_001031711),导致高度保守残基处的val98-to-glu(V98E)取代。该突变是通过外显子组测序发现的,与该疾病在亲属中分离,并且在 ExAC 数据库或 212 个种族匹配的对照中没有发现。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。

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