小卡哈尔体特异性 RNA 7; SCARNA7
snoRNA, U90
HGNC 批准的基因符号:SCARNA7
细胞遗传学定位:3q25.33 基因组坐标(GRCh38):3:160,514,907-160,515,236(来自 NCBI)
▼ 说明
小核仁 RNA(snoRNA),如 SCARNA7,充当指导 RNA 转录后修饰的向导。含有与纤维蛋白相关的C/D框的SnoRNA(FBL; 134795)和剪接体小核RNA(snRNA)的直接2-prime-O-核糖甲基化,而含有H/ACA框的那些与GAR1(NOLA1; 134795)相关。606468)和snRNA的直接假尿苷化。SCARNA7 包含一个 C/D 框,预计可引导 snRNA 的 2-prime-O-甲基化(Darzacq et al., 2002)。
▼ 克隆与表达
Darzacq 等人(2002)通过对 HeLa 细胞中与纤维蛋白免疫沉淀的 RNA 进行测序,鉴定出 SCARRNA7,并将其命名为 U90。330 个核苷酸的 RNA 包含保守的 5 引物框 C 和 3 引物框 D 基序以及内部 C 引物框和 D 引物框。在HeLa细胞中过表达后,荧光原位杂交和细胞分级分离显示U90与线圈蛋白(COIL; 600272),卡哈尔身体标记。
▼ 基因功能
Darzacq等人(2002)通过对HeLa细胞进行免疫沉淀分析,发现人U90与fibrillarin有相互作用,但与GAR1没有相互作用。
▼ 测绘
Hartz(2014)根据SCARNA7序列(GenBank AY077740)与基因组序列(GRCh37)的比对,将SCARNA7基因定位到染色体3q25.33。