小卡哈尔体特异性 RNA 7; SCARNA7

snoRNA, U90

HGNC 批准的基因符号:SCARNA7

细胞遗传学定位:3q25.33 基因组坐标(GRCh38):3:160,514,907-160,515,236(来自 NCBI)

▼ 说明

小核仁 RNA(snoRNA),如 SCARNA7,充当指导 RNA 转录后修饰的向导。含有与纤维蛋白相关的C/D框的SnoRNA(FBL; 134795)和剪接体小核RNA(snRNA)的直接2-prime-O-核糖甲基化,而含有H/ACA框的那些与GAR1(NOLA1; 134795)相关。606468)和snRNA的直接假尿苷化。SCARNA7 包含一个 C/D 框,预计可引导 snRNA 的 2-prime-O-甲基化(Darzacq et al., 2002)。

▼ 克隆与表达

Darzacq 等人(2002)通过对 HeLa 细胞中与纤维蛋白免疫沉淀的 RNA 进行测序,鉴定出 SCARRNA7,并将其命名为 U90。330 个核苷酸的 RNA 包含保守的 5 引物框 C 和 3 引物框 D 基序以及内部 C 引物框和 D 引物框。在HeLa细胞中过表达后,荧光原位杂交和细胞分级分离显示U90与线圈蛋白(COIL; 600272),卡哈尔身体标记。

▼ 基因功能

Darzacq等人(2002)通过对HeLa细胞进行免疫沉淀分析,发现人U90与fibrillarin有相互作用,但与GAR1没有相互作用。

▼ 测绘

Hartz(2014)根据SCARNA7序列(GenBank AY077740)与基因组序列(GRCh37)的比对,将SCARNA7基因定位到染色体3q25.33。

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