炎症性肠病 23; IBD23
细胞遗传学定位:1q32.1 基因组坐标(GRCh38):1:198,700,001-207,100,000
有关炎症性肠病(IBD)(包括克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC))遗传异质性的一般描述和讨论,请参见 IBD1(266600)。
▼ 测绘
在一项针对 304 名澳大利亚克罗恩病患者和 231 名健康对照者的病例对照研究中,Fowler 等人(2005)发现狭窄性疾病与 IL10 基因启动子 SNP(-1082G)的高产等位基因之间存在显着关联。 124092)染色体1q31-q32上以及TNF-α基因(TNF; 124092)上的一个SNP(-857C)191160)在染色体 6p21.3 上(参见 IBD3, 604519)。当这些等位基因组合并在多变量分析后持续存在时,这种关联最强。Fowler et al.(2005)得出结论,这2个SNP可能有助于预测克罗恩病患者的疾病行为。
Franke et al.(2008)在德国1,850名CD患者、1,103名UC患者和1,817名对照样本中调查了50个先前报道的IBD易感位点,并证实这两种CD均与1q32.1的SNP rs17419032相关(p = 0.0039) )和UC(p = 0.0017)。
对 3 项克罗恩病研究的数据进行荟萃分析,涉及总共 3,230 例病例和 4,829 名对照者(Rioux 等人,2007 年、Wellcome Trust 病例对照联盟,2007 年和 Libioulle 等人,2007 年),并在 3,664 名孤立受试者中进行复制Barrett et al.(2008)强烈证实了11个先前报道的位点,包括1q32的SNP rs11584383的关联(组合p = 1.43 x 10(-11));病例对照优势比,1.18)。
Franke 等人(2008)进行了一项全基因组关联研究,涉及 1,167 名 UC 患者和 777 名健康对照者中的 440,794 个 SNP 基因型,随后在 3 个孤立的欧洲病例对照小组(总共包括 1,855 个病例)中测试 20 个最显着相关的 SNP 的复制情况UC 患者和 3,091 名对照者。在4个一致复制的标记中,紧邻染色体1q32.1上IL10基因侧翼的rs3024505在组合验证样本中表现出最显着的关联(p = 1.35 x 10(-12);优势比,1.46)。rs3024505与克罗恩病的相关性较弱(p = 0.013;优势比,1.17),表明IL10功能缺陷是IBD UC亚型发病机制的核心。
Anderson et al.(2009)分析了2,527个UC病例和4,070个对照中29个CD相关位点的45个SNP,发现染色体1q32与2个紧密连锁不平衡的SNP关联性最强,rs2297909和rs11584383(p = 4.13 x 10(-) 8)和5.71×10(-7))。
在一项涉及 6 个小组、总共 3,139 例 UC 病例和 5,974 名对照的全基因组关联研究的综合分析中,Franke 等人(2010)证实了染色体 1q32.1 的关联。
McGovern 等人(2010)结合了 2 项涉及 266,047 个 SNP 的溃疡性结肠炎全基因组关联研究的新数据,并与之前发表的数据(Silverberg 等人,2009)进行了荟萃分析,从而汇集了 2,693 名欧洲 UC 患者和6,791 个控制;然后,荟萃分析的主要结果被孤立复制到另外 2,009 个欧洲 UC 病例和 1,580 个对照中。McGovern et al.(2010)在rs3024505证实了与UC的关联(组合p = 1.4 x 10(-8))。