泛素结合酶 E2 D3；UBE2D3

泛素结合酶 E2D 3
UBC4/5，酿酒酵母，同源物
泛素结合酶 UBCH5C；UBCH5C

HGNC 批准的基因符号：UBE2D3

细胞遗传学定位：4q24 基因组坐标（GRCh38）：4:102,794,383-102,868,895（来自 NCBI）

▼ 正文

有关泛素化和 E2 酶 UBC4/5 亚家族的一般信息，请参见 UBE2D1（602961）。

▼ 克隆与表达

使用基于UBCH5B（UBE2D2；602962），Jensen等人（1995）鉴定了编码UBCH5C或UBE2D3的人外周血淋巴细胞cDNA。预测的 147 个氨基酸的 UBCH5C 和 UBCH5B 蛋白仅相差 4 个氨基酸，其中 3 个差异为保守变化；它们的 cDNA 的核苷酸序列在编码区有 87% 相同，在 3 引物非翻译区有 23% 保守。UBCH5C蛋白与果蝇UbcD1蛋白序列同一性为94%，与线虫ubc2蛋白序列同一性为92%，与人UBCH5A（UBE2D1）序列同一性为88%，与酿酒酵母UBC4和UBC5、拟南芥UBC8和UBC9序列同一性为79%。经SDS-PAGE检测，在大肠杆菌中表达的重组UBCH5C的分子量为16 kD。定量PCR显示UBCH5C在所有检测的人体组织中都有表达，且表达水平高于UBCH5A和UBCH5B。

▼ 基因功能

Jensen et al.（1995）证明UBCH5C可以将泛素与E6AP（UBE3A；UBE3A；601623）依赖方式。

全反式维甲酸（RA）因引起APL细胞周期停滞和分化而被用于分化治疗以达到缓解急性早幼粒细胞白血病（APL）的目的。Hattori等人（2007）使用短发夹RNA筛选，在26种蛋白质中鉴定出了UBE2D3，这些蛋白质对于RA诱导的NB4人类早幼粒细胞的分化和生长停滞至关重要。NB4 细胞经 RA 处理后，UBE2D3 上调。UBE2D3 与细胞周期蛋白 D1（CCND1；CCND1）物理相关 168461）并介导RA诱导的细胞周期蛋白D1降解。通过 RNA 干扰敲低 UBE2D3 可阻止 RA 诱导的细胞周期蛋白 D1 降解和细胞周期停滞。Hattori et al.（2007）得出结论，泛素介导的蛋白水解作用参与了RA诱导的细胞周期停滞。

Shembade et al.（2010）表明，A20（191163）通过拮抗与E2泛素结合酶UBC13（603679）和UBCH5C的相互作用，抑制TRAF6（602355）、TRAF2（601895）和cIAP1（601712）的E3连接酶活性。A20与调节分子TAX1BP1（605326）一起与UBC13和UBCH5C相互作用，引发它们的泛素化和蛋白酶体依赖性降解。这些发现表明 A20 抑制炎症信号通路的作用机制。

Okiyoneda 等人（2010）鉴定了外周蛋白质量控制网络的组成部分，该网络从质膜上去除含有 F508del 突变（602421.0001）的未折叠 CFTR。基于他们的结果和不同亚细胞位置的蛋白抑制机制，Okiyoneda等人（2010）提出了一个模型，其中CFTR展开的细胞质区域的识别是由HSC70（600816）与DNAJA1（602837）协同介导的，并且可能是由HSP90机械（140571）。与伴侣蛋白复合物的长期相互作用会招募 CHIP（607207）-UBCH5C，并导致构象受损的 CFTR 泛素化。这种泛素化可能受到其他 E3 连接酶和去泛素化酶活性的影响，最终导致 Ub 结合网格蛋白转换因子和运输（ESCRT）机器所需的内体分选复合物介导的加速内吞作用和溶酶体递送。Hutt 和 Balch（2010）在附带的观点中评论说，蛋白质稳态网络维持的“阴阳”平衡对于正常细胞、组织和有机体生理学至关重要。

▼ 生化特征

晶体结构

McGinty等（2014）结晶化了Polycomb抑制复合物-1（PRC1）泛素化模块，这是一种由UBCH5C和最小的RING1B（608985）-BMI1（164831）环异二聚体组成的E2-E3酶复合物，与其核小体核心颗粒结合基质。作者以 3.3 埃的分辨率解析了该结构。该结构显示了染色质酶如何通过与空间上与催化位点不同的几个核小体表面相互作用来实现底物特异性。McGinty等人（2014）得出结论，该结构揭示了泛素E2酶在底物识别中的意想不到的作用，并提供了有关相关组蛋白H2A E3连接酶BRCA1（113705）如何与核小体相互作用并泛素化的见解。