凝集素,半乳糖苷结合,可溶,12
LGALS12
GALECTIN 12
HGNC 批准的基因符号:LGALS12
细胞遗传学定位:11q12.3 基因组坐标(GRCh38):11:63,506,084-63,516,772(来自 NCBI)
▼ 正文
半乳糖凝集素是具有保守碳水化合物识别域(CRD)的β-半乳糖苷结合动物凝集素。它们可能通过适当的细胞表面糖蛋白的交联参与各种细胞类型的激活。半乳糖凝集素也可能参与某些类型的癌症和细胞周期调节。
▼ 克隆与表达
通过对G1期Jurkat T细胞cDNA文库中随机选择的EST克隆进行测序,然后进行EST数据库搜索、视网膜cDNA文库上的5-prime RACE、基因组数据库搜索和PCR,Yang等(2001)获得编码半乳糖凝集素 12 或 LGALS12 的全长 cDNA。与其他半乳糖凝集素一样,推导的 314 个氨基酸蛋白缺乏信号序列和跨膜结构域。LGALS12 包含 2 个由连接序列分隔的 CRD,这种排列在一些半乳糖凝集素家族成员中发现。结合分析表明 LGALS12 具有乳糖结合活性。Northern 和 Western blot 分析显示,大多数组织中几乎检测不到 LGALS12 的表达。RT-PCR分析检测到在心脏、胰腺、脾脏、胸腺和外周血白细胞中表达,在肺、骨骼肌、肾、前列腺、睾丸、卵巢和结肠中表达较低,在脑、胎盘和结肠中几乎没有表达。肝。在造血细胞系和免疫细胞系中可检测到表达,但在其他测试的细胞系中未检测到表达。细胞在 G1 期的同步化(但不是在有丝分裂期)上调了 LGALS12 的表达。用 LGALS12(而非 LGALS9(601879))转染细胞,导致 G1 细胞周期停滞并消除癌细胞系的增殖。Yang等(2001)提出LGALS12可能是一个候选抑癌基因。
▼ 基因结构
Yang等(2001)通过基因组序列分析确定LGALS12基因含有9个外显子,其组织结构在其他半乳糖凝集素基因中保守。
▼ 测绘
Yang等(2001)根据LGALS12序列与多个11q13克隆之间的序列相似性,将LGALS12基因定位到11q13。