U2 小核 RNA 辅助因子 1-LIKE 4;U2AF1L4
U2AF1-样4
U2 小核核糖核蛋白辅助因子,小子单元 3;U2AF1RS3
U2 小核核糖核蛋白辅助因子,26-KD;U2AF26
HGNC 批准的基因符号:U2AF1L4
细胞遗传学定位:19q13.12 基因组坐标(GRCh38):19:35,742,464-35,745,418(来自 NCBI)
▼ 说明
U2AF1L4 编码一种 RNA 结合蛋白,作为前体 mRNA 剪接因子(Shepard et al., 2002)。
▼ 克隆与表达
Hatada等(1991)通过限制性标志基因组扫描分离出印迹基因U2af1rs1(601079)。该基因与人类核糖核蛋白辅助因子(U2AF1;RNA剪接所需的(191317)。Kitakawa et al.(1995)分离出3个小鼠U2af1rs1的人类同源物,包括U2af1rs3。作者没有从人脑文库中分离出该基因的 cDNA,并表明它可能代表假基因。
Shepard et al.(2002)克隆了小鼠U2af26,并通过数据库分析鉴定了其人类直系同源物。小鼠U2af26蛋白的计算分子量为26 kD,与小鼠U2af35(U2AF1;)有76%的同一性。191317),包括 187 个 N 端残基内的 89% 同一性。U2af26 包含 2 个 N 端锌指、一个非规范 RNA 识别基序以及 U2af35 用于与 U2af65 相互作用的几个保守残基(U2AF2; 191318)。与 U2af35 相比,U2af26 的 C 端区域包含较少的 RS 和 RE 二肽束,且均不相邻,并且没有甘氨酸束且富含脯氨酸。Northern印迹分析揭示了小鼠U2af26的普遍表达。U2af26与U2af35的表达比例在脑中最高,在肝脏中最低。免疫荧光显微镜显示 U2af26 的斑点核表达。
Heyd et al.(2008)从小鼠成纤维细胞中克隆了缺少外显子 7 或外显子 6 和 7 的 小鼠 U2af26 的 2 个剪接变体。缺乏外显子 6 和 7 的变体有移码,似乎是一个次要变体。与全长 U2af26 的核定位相反,缺乏外显子 7 的变体在转染细胞中表现出细胞质定位。Heyd 等人(2008)在 U2af26 的外显子 7 和 8 中鉴定出了与 U2AF35 中发现的核定位序列不同的核定位序列。
Didych et al.(2013)指出U2AF1L4和PSENEN(607632)基因处于头对头的方向,只有一个短序列分隔它们的第一个外显子。RT-PCR 分析显示这两个基因均具有中等组织特异性,但由于不同剪接形式的存在,U2AF1L4 的水平可能被低估。
▼ 基因结构
Shepard et al.(2002)确定U2AF26基因含有8个外显子。
Didych et al.(2013)鉴定了U2AF1L4和PSENEN基因共享的双向启动子。
▼ 测绘
Kitakawa等(1995)通过荧光原位杂交将U2AF1RS3基因定位到染色体19p13.2。
Didych et al.(2013)指出,U2AF1L4 和 PSENEN 基因处于头对头的方向,其第一个外显子仅间隔 157 bp。
▼ 基因功能
Shepard et al.(2002)利用凝胶过滤分析表明,小鼠U2af26与人U2AF65形成1:1的复合物。U2af26 作为前体 mRNA 剪接因子,可以替代人 U2AF35 并增强人 U2AF65 与弱 3 素剪接位点的结合。Shepard et al.(2002)提出U2AF26参与调节选择性剪接。
Heyd et al.(2008)发现p32(C1QBP;601269)与小鼠U2af26中的C端核定位序列相互作用。这种相互作用对于 U2af26 的核定位是必需的。Heyd et al.(2008)提出,U2AF26和U2AF35有2种不同的核输入途径,可以孤立控制它们的分布和剪接机制的可用性,也可能有助于选择性剪接的调节。
Didych等人(2013)克隆了包含U2AF1L4和PSENEN第一个外显子起始部分的269bp片段,并利用荧光素酶分析和荧光显微镜,发现两个基因同时表达。Didych et al.(2013)得出结论,PSENEN和U2AF1L4基因之间的短DNA区域充当结合多个特征转录因子的双向启动子。他们指出,U2AF1L4 和 PSENEN 都参与 T 细胞活性的调节。