序列相似度90的家族,成员A7;FAM90A7

FAM90A 副本 8

HGNC 批准的基因符号:FAM90A7

细胞遗传学定位:8p23.1 基因组坐标(GRCh38):8:7,556,700-7,559,712(来自 NCBI)

▼ 说明

FAM90A7属于灵长类特异性FAM90A基因家族的II亚家族,起源于多次重复和重排(Bosch et al., 2007)。有关FAM90A基因家族的背景信息以及FAM90A基因进化的信息,请参见FAM90A1(613041)。

▼ 克隆与表达

通过对人类基因组序列(build 36.1)的分析,Bosch et al.(2007)在染色体12p上鉴定出了FAM90A1基因,在染色体8p上鉴定出了另外24个FAM90A基因和假基因,包括FAM90A7。Bosch et al.(2007)将FAM90A7称为FAM90A copy 8。推导的434个氨基酸的FAM90A7蛋白含有CCHC型锌指基序,表明它可能与RNA或DNA相互作用。使用不区分各个 FAM90A 基因的引物进行的 RT-PCR 表明,FAM90A 亚家族 II 的成员(例如 FAM90A7)普遍表达。

▼ 基因结构

Bosch et al.(2007)确定FAM90A7基因含有5个外显子。外显子 1 是非编码的,包含 LINE 元件 L1MB3,最后一个外显子的序列 3-prime 包含 ERV-K 家族的长末端重复序列。与 FAM90A 亚家族 II 的其他成员一样,FAM90A7 在其 5 素末端缺乏重复序列。

▼ 测绘

通过对基因组序列(build 36.1)的分析,Bosch et al.(2007)将FAM90A7基因定位到染色体8p23.1(坐标7401070至7406391)。它是 FAM90A 重复区域内的第八个 FAM90A 拷贝(从远端到近端),位于簇 B 内,簇 B 还包括 FAM90A6P、FAM90A21P、FAM90A22 和 FAM90A23。簇 B 中的 FAM90A 拷贝在反向链上从头到尾定向。

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