锌指蛋白 473;ZNF473

锌指蛋白,100-KD;ZFP100
KIAA1141

HGNC 批准的基因符号:ZNF473

细胞遗传学定位:19q13.33 基因组坐标(GRCh38):19:50,026,005-50,048,776(来自 NCBI)

▼ 说明

U7 小核核糖核蛋白(snRNP)(参见 RNU7-1, 617876)在加工组蛋白前体 mRNA 的独特 3 素茎环结构中具有特定作用。ZNF473 是一种 C2H2 锌指蛋白,可与 U7 snRNP 短暂结合,是 U7 snRNP 稳定性和组蛋白 3 引物前 mRNA 加工所必需的(Wagner 和 Marzluff,2006)。

▼ 克隆与表达

Hirosawa 等人(1999)通过对从尺寸分级的人脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,克隆了 ZNF473,并将其命名为 KIAA1141。转录物在其 3-prime 末端含有一个重复元件,推导的蛋白质含有 914 个氨基酸。由于KIAA1141与人类ZNF91(603971)的相似性,预计其将参与核酸管理。RT-PCR 检测到肺、肝和卵巢中 KIAA1141 表达最高。除成人睾丸和骨骼肌几乎没有表达或没有表达外,在所有其他检查的成人和胎儿组织中均检测到较低的表达。在所检查的所有特定成人大脑区域中均检测到可变表达。

使用改良的酵母2-杂交测定法来鉴定与3-prime组蛋白mRNA茎环结构和茎环结合蛋白(SLBP;SLBP;SLBP)相互作用的HeLa细胞核蛋白。602422),Dominski et al.(2002)克隆了ZNF473,他们将其命名为ZFP100。推导的 871 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 101 kD。ZFP100的N端有一个Kruppel相关框(KRAB)结构域,后面是18个C2H2型锌指。ZFP100 C 端部分中的三个指间间隔区(称为 H/C 连接)包含保守序列 TGEKPY,该序列存在于近一半 DNA 结合 C2H2 锌指蛋白中。

Wagner et al.(2006)发现荧光标记的人ZFP100集中在转染的HeLa细胞的核灶中。ZFP100 集中在 Cajal 小体附近,这些小体通常位于复制依赖性组蛋白基因簇附近。数据库分析仅在哺乳动物中鉴定出 ZFP100 的直向同源物,在中央核心锌指 4 至 8 内具有最强的保守性。

▼ 基因功能

Dominski et al.(2002)发现,在存在茎环RNA的情况下,人ZFP100与SLBP结合,但在不存在RNA或仅与RNA的情况下,它不与SLBP相互作用。ZFP100 不与组蛋白前体 mRNA 加工缺陷的突变体 SLBP 相互作用。突变分析和小基因实验表明,ZFP100 的残基 312 至 552(包含锌指 2 至 8)是与 SLBP 和茎环 RNA 相互作用所必需的。免疫沉淀分析证实 ZFP100 与 HeLa 细胞核提取物中的 U7 snRNA 相互作用。在将组蛋白 RNA 注射到非洲爪蟾卵核中之前注射人 ZFP100 增强了组蛋白 RNA 的 3-prime 末端加工。

Wagner et al.(2006)通过突变分析发现,ZFP100 的锌指 2 至 6 对于维持 Cajal 体定位是必需的。锌指 5 至 10 有助于 ZFP100 与 U7 snRNP 蛋白 LSM11(617910)的 N 末端富含精氨酸和甘氨酸的区域相互作用。ZFP100 的锌指 2 至 10 的中央保守核心是组蛋白前 mRNA 加工所必需的。

Wagner 和 Marzluff(2006)利用模拟组蛋白 mRNA 3-prime 茎环结构的报告基因发现,ZFP100 在转染的人类细胞系中促进组蛋白茎环结构的剂量依赖性加工。ZFP100 的敲低,但 U7 snRNP 特异性子单元 LSM10(617909)或 LSM11 的敲低,报告基因活性降低。HeLa 或 U2OS 细胞中 ZFP100、LSM10 或 LSM11 的耗尽导致细胞周期停滞在 G1 期。LSM10 或 LSM11 的过表达(而非 ZFP100)增加了 U7 snRNP 的细胞含量。Wagner and Marzluff(2006)得出结论,LSM10和LSM11增加了U7 snRNP的细胞含量,而ZFP100特异性地增加了U7 snRNP在组蛋白mRNA加工中的活性。

▼ 基因结构

Wagner et al.(2006)报道ZNF473基因有5个外显子。

Dominski et al.(2002)在ZNF473基因的上游区域发现了一个TATAA框。

▼ 测绘

Dominski et al.(2002)指出ZNF473对应到染色体19q13.33。

Wagner et al.(2006)将小鼠 Znf473 基因定位到与人类染色体 19q13.33 具有同线性同源性的染色体 7 区域。

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