多种凝血因子缺乏蛋白 2; MCFD2

HGNC 批准基因符号:MCFD2

细胞遗传学定位:2p21 基因组坐标(GRCh38):2:46,901,870-46,941,855(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Deka等人(1988)克隆了一个基因,他们将其命名为T+,因为在异常长的3-prime非翻译区中存在类似转座子的人类重复元件(THE1)。推导的蛋白质包含 79 个氨基酸,在保守的 12 个氨基酸基序中与肌钙蛋白-c(参见 191040)和钙调蛋白(参见 114180)具有显着相似性。Deka等人(1988)还鉴定了一个转录假基因,他们将其称为T-,其中包含散布的Alu重复序列而不是THE1元件。组织和细胞系的 Northern 印迹分析检测到 4.0、3.0、1.9 和 0.85 kb 的主要转录本。在神经母细胞瘤样本中也检测到了 2.5 kb 的转录物。4.0-和 1.9-kb 转录本存在于 HeLa 细胞多核糖体部分中,导致作者得出结论,它们可能是翻译的。

张等人(2003)采用定位克隆策略,寻找导致因子V和因子VIII联合缺陷形式的基因,该基因定位于2p21-p16.3(F5F8D2;613625)。人类基因组序列草案中大约2.4 Mb的候选遗传区间包含大约20个已知和预测的基因和一些部分EST,其中没有一个与已知的内质网(ER)或高尔基体成分具有序列同源性。对单个候选基因进行直接 DNA 测序,确定了部分 cDNA HUMTRANSC 的预测外显子和内含子-外显子连接处的突变,该部分 cDNA HUMTRANSC 先前是根据其包含 THE1 的异常长的 3 素非翻译区报道的。该基因被Zhang等人(2003)更名为MCFD2(多种凝血因子缺乏蛋白-2),包含一个145个氨基酸的开放解读码组,与Deka等人(1988)报道的T+基因相同。显着特征包括 N 末端的预测信号肽和 C 末端假定的钙结合的 2 个钙调蛋白样 EF 手。Northern blot分析显示MCFD2在多种组织中表达。

▼ 基因功能

张等人(2003)表明MCFD2和LMAN1基因发生突变,最常见的形式是F5F8D(F5F8D1; 227300),共定位于内质网-高尔基体中间室(ERGIC),并且 MCFD2 通过与 LMAN1 直接的钙依赖性相互作用定位于 ERGIC。

▼ 基因结构

张等人(2003)确定MCFD2基因包含4个外显子,包含大约19 kb的基因组DNA。Deka等(1988)确定MCFD2基因的启动子区含有CAAT元件和TATA元件。THE1元件的方向与基因的相反。

▼ 测绘

张等人(2003)在与F5F8D相关的染色体2p21-p16.3的关键区域内鉴定了MCFD2基因。

▼ 分子遗传学

张等人(2003)在 MCFD2 基因中发现了 7 个不同的突变,导致 12 个家族中的 9 个家族中的 F5F8D。其中1个家族中的受影响个体是Oeri等人(1954)报道的原始F5F8D先证者之一。大多数突变导致无效等位基因,完全缺乏蛋白质表达(607788.0001-607788.0005)。另外2个突变为错义(607788.0006-607788.0007)。HeLa 细胞的体外功能表达研究表明,LMAN1 不与错义突变体 MCFD2 共免疫沉淀。结果表明,MCFD2 的第二个 EF 手在与 LMAN1 的钙依赖性相互作用以及 MCFD2-LMAN1 复合物在因子 V 和因子 VIII 转运中的后续功能中发挥着重要作用。

张等人(2008)在 4 个因子 V 和因子 VIII 联合缺乏的受影响家庭成员中鉴定出 4 种不同的 MCFD2 突变(参见例如 607788.0008)。这些家庭有希腊血统、加勒比非洲裔血统、沙特阿拉伯血统和意大利血统。

▼ 等位基因变异体(8个精选示例):

.0001 因素 V 和因素 VIII,2 的综合缺陷

MCFD2,149G-A,+5

在2个因子V和因子VIII联合缺陷的家系(613625)中,Zhang等(2003)在MCFD2基因中发现了供体剪接位点突变149+5G-A。其中一个家族首先被描述为因子 V 和因子 VIII 联合缺乏(Oeri et al., 1954)。

.0002 因素 V 和因素 VIII,2 的综合缺陷

MCFD2、309G-A、+1

在2个同时缺乏因子V和VIII的家系(613625)中,Zhang等(2003)在MCFD2基因中发现了供体剪接位点突变309+1G-A。

.0003 因素 V 和因素 VIII,2 的综合缺陷

MCFD2、1-BP DEL、103C

在一个因子V和因子VIII联合缺陷的家系(613625)中,Zhang et al.(2003)发现了一个1-bp缺失,103delC,导致MCFD2蛋白第35位残基发生移码。

.0004 因素 V 和因素 VIII,2 的综合缺陷

MCFD2,1-BP DEL,249T

在一个因子V和因子VIII联合缺陷的家系(613625)中,Zhang等(2003)发现了1个bp的缺失,即249delT,导致MCFD2蛋白的第83位残基发生移码。

.0005 因素 V 和因素 VIII,2 的综合缺陷

MCFD2、8-BP DEL、NT263

在一个因子V和因子VIII联合缺陷的家系(613625)中,Zhang et al.(2003)发现MCFD2基因第263-270位核苷酸(263-270delTTGATGGC)缺失,导致第88位残基发生移码。

.0006 因素 V 和因素 VIII,2 的综合缺陷

MCFD2、ASP129GLU

在一个同时缺乏V和VIII因子的家系(613625)中,Zhang et al.(2003)发现MCFD2基因中存在387C-G颠换,导致高度保守的残基由asp129变为-glu(D129E)在 MCFD2 的第二个 EF 手域内。HeLa 细胞的体外功能表达研究表明,尽管 D129E 突变蛋白以高水平合成,但 LMAN1 不与 D129E 突变蛋白共免疫沉淀。

.0007 因素 V 和因素 VIII,2 的综合缺陷

MCFD2、ILE136THR

在一个同时缺乏V和VIII因子的家系(613625)中,Zhang et al.(2003)发现MCFD2基因中存在407T-C转换,导致高度保守的残基由ile136变为thr(I136T)在 MCFD2 的第二个 EF 手域内。HeLa 细胞中的体外功能表达研究表明,LMAN1 不与 I136T 突变蛋白共免疫沉淀,尽管突变蛋白的合成水平较高。

.0008 因素 V 和因素 VIII,2 的综合缺陷

MCFD2、ASP81TYR

在一个同时缺乏因子 V 和 VIII 的家系(613625)的受影响成员中,Zhang et al.(2008)在 MCFD2 基因中发现了纯合的 241G-T 颠换,导致了 asp81 到 tyr(D81Y)的取代。 1 个 EF-hand 结构域内高度保守的残基。COS-1 细胞的体外功能表达研究表明,D81Y 突变蛋白未能与 LMAN1 共免疫沉淀。

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