富含脯氨酸的蛋白质 13;PRR13

紫杉醇抗性基因1;TXR1

HGNC 批准的基因符号:PRR13

细胞遗传学定位:12q13.13 基因组坐标(GRCh38):12:53,441,734-53,446,638(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

紫杉烷类,例如紫杉醇和多西紫杉醇,是一类化疗药物,对多种癌症具有抗肿瘤作用。Lih等人(2006)通过筛选逆转录病毒感染的前列腺癌细胞系中显示紫杉醇抗性的克隆,然后进行基于PCR的基因组步移和数据库分析,鉴定了PRR13的3个剪接变体,他们将其称为TXR1。两个变体仅在 5 素 UTR 上有所不同,并编码 148 个氨基酸的蛋白质,计算分子量为 15.2 kD。第三个变体有 5 个引物缺失,编码缺少前 56 个氨基酸的蛋白质。全长 TXR1 蛋白具有富含脯氨酸的 N 末端和富含组氨酸和赖氨酸的 C 末端,还包含 10 个连续的丝氨酸。二级结构分析揭示了几个假定的 N 端 α 螺旋和 C 端 β 折叠结构。Northern 印迹分析检测到 1.2 kb 转录物的广泛表达,在心脏、肾脏和白细胞中表达水平最高。蛋白质印迹分析显示前列腺癌细胞系中存在 18 kD TXR1 蛋白。

▼ 基因功能

Lih et al.(2006)表明,TXR1的上调通过转录下调抗血管生成和促凋亡蛋白TSP1或THBS1的产生来阻止紫杉烷诱导的肿瘤细胞凋亡。188060)。降低 TXR1 水平或使用 TSP1 或 TSP1 模拟肽进行处理,可通过激活 CD47(601028)信号传导使细胞对紫杉烷细胞毒性敏感,而干扰 CD47 功能可减少紫杉烷诱导的细胞死亡。在所检查的 19 个癌细胞系中,有 13 个细胞系中 TXR1 和 TSP1 的细胞丰度呈负相关,紫杉醇细胞毒性与 TXR1 表达呈负相关,与 TSP1 表达呈正相关。Lih et al.(2006)得出结论,TXR1是TSP1产生的调节因子。

▼ 基因结构

Lih et al.(2006)确定PRR13基因含有4个外显子,跨度为5 kb。

▼ 测绘

Lih等(2006)通过基因组序列分析,将PRR13基因定位到染色体12q13.13。

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