肢体和中枢神经系统表达 1; LIX1
肢体表达 1, 鼠标, 同源物
HGNC 批准的基因符号:LIX1
细胞遗传学定位:5q15 基因组坐标(GRCh38):5:97,091,867-97,142,611(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Swindell等人(2001)通过筛选鸡肢体发育相关基因,克隆了Lix1。通过数据库分析,他们鉴定了人类 LIX1 以及几种脊椎动物和无脊椎动物物种的直向同源物。推导的 282 个氨基酸的人类蛋白质与鸡 Lix1 有 83% 的同一性。
通过对发育中的小鼠胚胎进行原位杂交,Moeller 等人(2002)检测到 Lix1 的表达从胚胎第 8 天开始并在整个发育过程中持续存在。Lix1 在皮质板、室下区、出生后皮质第 5 层、黑质、背根神经节、脑干特定核团和脊髓中表达。肢芽和面部原基表现出短暂的表情。
通过寻找与猫科动物 Lix1 相似的基因,Fyfe 等人(2006)鉴定了人类 LIX1 和来自多个物种的直系同源物。他们发现人类和猫科动物的转录物在5-prime非翻译区(UTR)中显示出95%的序列同一性,其中包括一个推定的茎环结构,在3-prime UTR中显示出75%的序列同一性,其中包括4个聚腺苷酸化信号。推断出的人类和猫科动物蛋白质具有 97% 的氨基酸同一性,并且包含 RNA 代谢或运输蛋白质中常见的双链 RNA 结合结构域。
▼ 测绘
Fyfe et al.(2006)通过基因组序列分析,将LIX1基因定位到染色体5q15。
▼ 动物模型
Fyfe et al.(2006)对家猫常染色体隐性脊髓性肌萎缩症(SMA)模型进行了分子表征,类似于III型SMA(SMA3;253400),伴有青少年发病的骨骼肌萎缩和无力。在受影响的猫中,他们在猫染色体A1q的Lix1/Lnpep(151300)位点发现了一个纯合的140-kb缺失,与人类染色体5q15具有同源同源性。Lix1 基因的内含子 3 和 Lnpep 基因的内含子 1 中的断点阻止了这两个基因的表达。