SORTING NEXIN 5; SNX5
HGNC 批准基因符号:SNX5
细胞遗传学定位:20p11.23 基因组坐标(GRCh38):20:17,941,600-17,968,794(来自 NCBI)
▼ 说明
SNX5 是分选 nexin 分子家族的成员,该分子包含大约 100 个氨基酸的区域,称为 phox 同源(PX)结构域(Otsuki 等人,1999)。
▼ 克隆与表达
Otsuki等人(1999)使用FANCA(607139)片段作为诱饵进行酵母2-杂交筛选,将SNX5鉴定为假定的FANCA结合蛋白。Northern 印迹分析检测到 2.2 和 1.6 kb 的 2 个 SNX5 转录本,它们在测试的组织和细胞系中以不同的量存在。在骨骼肌和肾脏以及 T 细胞白血病、结肠腺癌和肺癌细胞系中发现水平最高,在脑、胎盘、肺和肝脏中发现水平最低。
▼ 测绘
国际辐射混合图谱联盟将SNX5基因定位到染色体20(stSG9992)。
▼ 基因功能
Otsuki等人(1999)通过免疫沉淀研究证实了FANCA和SNX5之间的相互作用。缺失突变体分析表明,PX 结构域不是与 FANCA 结合所必需的,但 SNX5 的中心区域是必需的。Otsuki et al.(1999)发现SNX5的过度表达增加了FANCA蛋白水平,因此他们提出FANCA可能影响SNX5与细胞表面受体的交通。
细胞表面受体CED1(107770)介导吞噬细胞对凋亡细胞的识别,从而实现线虫体内细胞尸体的清除。Chen et al.(2010)发现线虫细胞内蛋白质分选复合体retromer通过介导CED1的再循环来清除细胞尸体。哺乳动物逆转录酶复合体包含分选连接蛋白1和2(601272, 605929)(线虫同源snx1)和5和6(606098)(线虫同源snx6)。逆转录酶被招募到含有细胞尸体的吞噬体表面,其功能丧失导致细胞尸体去除缺陷。逆转录酶可能通过与细胞尸体识别途径中的 CED1 直接相互作用发挥作用。在缺乏逆转录酶功能的情况下,CED1 与溶酶体结合,无法从吞噬体和细胞质再循环到质膜。因此,Chen等人(2010)得出结论,retromer是细胞凋亡过程中通过调节吞噬受体吞噬细胞凋亡的重要介质。