CHRNA7/FAM7A 融合基因; CHRFAM7A

HGNC 批准的基因符号：CHRFAM7A

细胞遗传学定位：15q13.2 基因组坐标（GRCh38）：15:30,360,566-30,393,900（来自 NCBI）

▼ 说明

染色体 15 上的 CHRFAM7A 基因是一个杂合体，由部分重复的 CHRNA7 基因（118511）与 FAM7A 基因的拷贝融合而成（Riley et al., 2002）。

▼ 克隆与表达

通过序列分析、海马 mRNA 5-prime RACE 和 EST 数据库分析，Gault 等人（1998）克隆了 CHRFAM7A，该基因由 CHRNA7 基因的 5 至 10 外显子重复组成，融合了 3-prime 和 4 个新外显子（D、C、B、A）。全长转录物和缺乏外显子 B 的剪接变体均得到表达。

Riley等人（2002）通过5-prime RACE鉴定出CHRFAM7A剪接变体，在外显子B和A之间含有一个新的外显子，外显子E。他们确定CHRFAM7A的外显子E到A代表FAM7A基因的重复，这在染色体 15 上复制多次。

de Lucas-Cerrillo 等人（2011）使用 RT-PCR，从丘脑和巨噬细胞 RNA 中克隆了全长人类 CHRFAM7A，他们将其称为 DUP-α-7。推导的 412 个氨基酸的蛋白质具有 4 个跨膜结构域、胞外 N 和 C 末端以及跨膜结构域 3 和 4 之间的长胞内环。CHRMFAM7A 缺乏 CHRNA7 的长 N 端结构域，因此缺乏乙酰胆碱（ACh）的识别位点和α-银环蛇毒素。Northern blot分析在HL-60人髓性白血病细胞和人皮质中检测到约3.9 kb的CHRFAM7A转录物。在人类皮质中也检测到了 5.8、3.3、2.1 和 1.4 kb 的转录本。定量PCR显示，人类皮质中CHRNA7的表达高于CHRFAM7A，而CHRFAM7A在巨噬细胞中占主导地位。

▼ 基因功能

de Lucas-Cerrillo et al.（2011）通过对转染的GH4C1大鼠垂体细胞和注射的非洲爪蟾卵母细胞进行电生理记录，发现CHRFAM7A对ACh引发的CHRNA7电流的幅度具有显性负效应，这是由于表面表达减少所致CHRNA7 的。刺激巨噬细胞中的 CHRNA7 会诱导抗炎反应。De Lucas-Cerrillo et al.（2011）发现细胞因子IL1-β（IL1B; 147720）和脂多糖降低了巨噬细胞中 CHRFAM7A 的表达，表明存在减弱炎症反应的反馈环路。尼古丁还显着降低人类巨噬细胞中 CHRFAM7A mRNA 的表达。

▼ 基因结构

Gault et al.（1998）确定CHRFAM7A基因含有10个外显子。Riley et al.（2002）鉴定了一个额外的 CHRFAM7A 外显子。

▼ 测绘

通过基因组序列分析，Gault等（1998）将CHRFAM7A基因定位到染色体15q13-q14，即CHRNA7基因的约1Mb着丝粒。Riley等人（2002）确定CHRFAM7A基因与CHRNA7基因方向相反。

▼ 分子遗传学

Gault 等人（1998）在研究的所有 14 名正常个体中鉴定出了 CHRFAM7A 基因。

Riley等人（2002）发现CHRFAM7A基因存在于南非班图家族精神分裂症样本的大多数个体中（见181500）。然而，他们确定了一对缺乏 CHRFAM7A 的父子，并得出结论，虽然 CHRFAM7A 普遍存在，但并非每个人类染色体 15 都有代表。Flomen 等人（2008）指出，CHRFAM7A 无效等位基因的出现频率约为 10%。

CHRFAM7A 基因的结构和方向表明，自 CHRNA7 部分重复以来发生了倒位。Flomen et al.（2008）利用FISH分析研究了12个个体的间期染色体，证实了多态性倒转的发生，并发现CHRFAM7A在两个方向上都以相似的频率存在。CHRFAM7A 6 号外显子的 2 bp 缺失多态性与倒位多态性存在强连锁不平衡（p = 0.00003），通常发生在 CHRFAM7A 与 CHRNA7 方向相同时。Flomen et al.（2008）指出，精神分裂症的内表型与2-bp缺失的关联可能是由于含有CHRFAM7A的双倍子的方向所致。

▼ 进化

CHRNA7的部分重复是最近人类特有的分子事件，在其他高等灵长类动物中仅存在CHRNA7而不存在CHRFAM7A（Flomen et al., 2008）。