ZFP90 锌指蛋白;ZFP90

锌指蛋白 90,小鼠,同源物
NK10
KIAA1954

包含 FOXP3 相互作用的 KRAB 结构域蛋白;FIK,包括

HGNC 批准的基因符号:ZFP90

细胞遗传学定位:16q22.1 基因组坐标(GRCh38):16:68,533,479-68,576,506(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Lange et al.(1995)克隆了小鼠Zfp90,他们将其命名为Nk10。主要 cDNA 编码的蛋白质的计算分子量为 72.4 kD。Zfp90 的 N 端一半包含 KRAB A 和 B 结构域,C 端一半包含 13 个 C2H2 型锌指基序。Lange et al.(1995)还鉴定了具有外显子 4 和 5 的 5-prime 延伸的选择性剪接 Zfp90 cDNA。Northern blot 分析检测到 2.4-kb 转录物在脑、心脏、脾脏和胸腺中表达水平最高。RT-PCR 小鼠胚胎检测到 Zfp90 主要在大脑中表达。大约在出生后第 2 周,它在大多数其他测试组织中表达。出生后 18 至 20 天,在睾丸组织中检测到它,同时出现单倍体细胞。

Nagase等人(2001)通过对从大小分级的胎脑cDNA文库中获得的克隆进行测序,获得了部分ZFP90克隆,他们将其命名为KIAA1954。该转录本的 3 素数 UTR 中包含 2 个 SINE。推导蛋白与ZNF471(620162)有50%的同源性,与盐杆菌转录起始因子IIB5有85%的同源性。RT-PCR ELISA 检测到所有成人和胎儿组织以及所检查的特定脑区域中的中等到高表达。在整个组织中,ZPF90 表达最高的是脾脏。在特定的大脑区域内,最高表达是在尾状核和黑质中。

Huang et al.(2013)利用酵母2-hybrid筛选人类调节性T细胞(Treg)cDNA文库,以FOXP3(300292)的N端区域为诱饵,孤立出ZFP90的剪接变体,并将其命名为FIK 。FIK mRNA 由 ZFP90 的前 3 个外显子组成,后跟先前报道的 ZFP90 基因的新序列 3-prime。推导的 113 个氨基酸的 FIK 蛋白包含 ZFP90 的前 85 个氨基酸和 26 个氨基酸的独特 C 端序列。FIK保留了ZPF90的N端KRAB结构域,其中包含一个与KAP1(TRIM28;601742)。作者指出,样本 Zfp90 中不存在编码 FIK 独特 C 端序列的区域。

▼ 基因功能

Lange et al.(1995)证明小鼠Zfp90可以结合DNA。结合是锌依赖性的,需要锌指 2 至 8。Zfp90 的 KRAB 结构域抑制报告基因表达。单独的 KRAB A 结构域可将报告基因表达降低 75% 至 80%,KRAB B 结构域将表达降低 10% 至 20%。两个结构域一起几乎完全抑制报告基因的表达。

Huang等(2013)通过酵母2-杂交和免疫共沉淀分析表明,FOXP3富含脯氨酸的N末端与FIK的C末端相互作用。他们指出,FOXP3 的这个区域还与 IKZF4(606239)和 KAT5(601409)相互作用,表明它参与调节抑制性染色质重塑复合物。Jurkat T细胞中FOXP3和FIK的表达导致IL2(147680)和IFNG(147570)的表达降低,染色质免疫沉淀分析显示FOXP3、FIK和KAP1存在于IL2和IFNG启动子的同一位点。FIK 在 Tregs 中高表达,破坏 Tregs 中的 FOXP3-FIK-KAP1 复合物会消除其抑制活性。Huang等(2013)得出结论,FIK在调节FOXP3活性和Treg功能中具有关键作用。

▼ 基因结构

Lange et al.(1995)确定小鼠Zfp90基因含有5个外显子。

▼ 测绘

Nagase等(2001)通过基因组序列分析,将ZFP90基因定位到染色体16。Lange等(1995)利用回交分析,将小鼠Zfp90基因定位到与人类同线性的染色体8D3区域。染色体16q22.1。

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