前 B 细胞白血病转录因子 3; PBX3

HGNC 批准基因符号:PBX3

细胞遗传学定位:9q33.3 基因组坐标(GRCh38):9:125,747,373-125,967,377(来自 NCBI)

▼ 说明

PBX3属于TALE(3-氨基酸环延伸)同源域转录因子的保守PBX家族,与发育基因表达有关。PBX 蛋白形成异寡聚 DNA 结合复合物,调节各种细胞类型中的转录(Rhee 等人总结,2004)。

▼ 克隆与表达

Monica等(1991)基于与PBX1(176310)广泛的同源性,孤立出2个新的同源基因PBX2(176311)和PBX3。预测的 PBX2 和 PBX3 蛋白在其同源域内及其侧翼的 266 个氨基酸区域与 PBX1 具有 92% 和 94% 的同一性,但所有 3 种蛋白在其 N 和 C 末端附近存在显着差异。与不在淋巴细胞系中表达的PBX1不同,PBX2和PBX3的表达并不限于特定的分化或发育状态,因为在大多数胎儿和成人组织以及所有细胞系中都检测到这些基因的mRNA转录本。与 PBX1 RNA 一样,PBX3 RNA 被选择性剪接以产生具有不同羧基末端的 2 个产物,这是 PBX2 未观察到的特征。它们广泛的序列相似性和广泛的表达表明 PBX 蛋白在大多数细胞类型中具有普遍的、重叠的作用。它们的 N 和 C 末端的差异可能会调节它们的活性,部分是通过差异剪接介导的,对于 PBX1,是通过 t(1;19)染色体易位后的蛋白质融合介导的。

通过对红白血病细胞系 cDNA 文库进行 PCR,Milech 等人(2001)克隆了 PBX3 的 2 个新剪接变体,他们将其命名为 PBX3C 和 PBX3D。PBX3C 和 PBX3D 均编码 N 端截短的异构体,缺乏 Monica 等人(1991)报道的 PBX3A 和 PBX3B 异构体的 PBC-A 结构域和大部分 PBC-B 结构域。RT-PCR 检测到所有细胞系和原代细胞(包括 17 个白血病细胞系)中 PBX3C 和 PBX3D 的表达。PBX3D在正常细胞中的表达高于PBX3C,而PBX3C在白血病细胞中的表达更高。

Rhee等(2004)通过免疫组化分析检测小鼠胚胎中枢和周围神经系统中Pbx3的表达。

▼ 基因结构

Milech等(2001)确定PBX3基因含有9个外显子,其中外显子3和7存在可变剪接。

▼ 测绘

Monica et al.(1991)通过原位杂交将PBX3定位到染色体9q33-q34。Pilz et al.(1994)将同源基因定位到小鼠染色体2。

作为对染色体 1、6 和 9 上发生的几个兆碱基三倍体的研究的一部分,Katsanis 等人(1996)证实了染色体 9q34 上存在 PBX 基因座。

▼ 基因功能

Milech et al.(2001)发现,与PBX3B相比,PBX3C和PBX3D亚型无法与PREP1(PKNOX1; 602100),与MEIS1(601739)的相互作用较弱。Milech et al.(2001)提出,PBX3C和PBX3D可能通过替代PBX3复合物形成与其他PBX蛋白相反的作用,从而影响PBX3介导的转录调节。

▼ 动物模型

Rhee et al.(2004)发现Pbx3+/-小鼠具有存活能力和生育能力。相比之下,Pbx3 -/- 小鼠在出生后数小时内就因呼吸暂停、紫绀以及肺充气和通气不足而死亡,尽管其大脑和脊髓的神经结构正常。Pbx3 -/- 小鼠中 Rnx(604640)和 Meis1 的表达不受影响,但在 Pbx3 缺失的情况下,Rnx 无法与 TALE 蛋白(如 Meis1)形成复合物来增强转录。Rhee et al.(2004)得出结论,PBX3A和RNX与MEIS1一起对于呼吸和延髓呼吸控制机制的正常发展至关重要。他们提出 Pbx3 或 Rnx 缺乏可能模拟中枢性通气不足综合征(见 209880)。

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