微 RNA 449A; MIR449A
miRNA449A
MIRN449A
HGNC 批准的基因符号:MIR449A
细胞遗传学定位:5q11.2 基因组坐标(GRCh38):5:55,170,532-55,170,622(来自 NCBI)
▼ 说明
MicroRNA(miRNA)是短链非编码RNA,通过抑制mRNA或诱导mRNA降解来调节基因表达。miRNA MIR449A和MIR449B(613132)位于CDC20B(620335)基因的内含子1内,它们与CDC20B共享一个共同的启动子(Yang et al., 2009)。
▼ 克隆与表达
Yang等人(2009)利用miRNA分析鉴定人骨肉瘤细胞系中的E2F1(189971)靶基因,鉴定出MIR449A和MIR449B。两种 miRNA 具有相同的种子序列:5-prime-GGCAGUG-3-prime。
Noonan et al.(2009)发现成熟的MIR449A序列在脊椎动物中高度保守,并且在大多数哺乳动物中是相同的,包括人、猴、马、啮齿动物和狗。
▼ 基因功能
Yang等人(2009)使用定量实时PCR证实E2F1在许多人类细胞系中诱导强MIR449A和MIR449B表达。这些 miRNA 的表达与细胞周期中内源性 E2F1 激活密切相关。E2F1 还诱导 MIR449A 和 MIR449B 宿主基因 CDC20B 的表达。染色质免疫沉淀分析结合定量 PCR 和报告基因测定证实 E2F1 结合并激活共同的 MIR449A-MIR449B-CDC20B 启动子。Yang等人(2009)在CDK6(603368)和CDC25A(116947)的3-prime UTR中鉴定了MIR449结合位点,并使用多种技术证明了MIR449A对CDK6和CDC25A的下调。转染 MIR449A 模拟物,通过抑制 RB1(614041)-E2F1 途径(包括 CDK6 和 CDC25A),在多种人类癌细胞系中诱导细胞周期停滞在 G1 期。与正常上皮细胞系相比,一组癌细胞系中 MIR449A 和 MIR449B 的表达下调,并且这种下调似乎是通过 MIR449A-MIR449B-CDC20B 启动子的组蛋白甲基化在表观遗传学上发生的。
Noonan et al.(2009)利用实时PCR发现,与患者匹配的对照相比,MIR449A在前列腺癌组织中表达下调。将 MIR449A 引入人前列腺癌细胞会导致细胞周期停滞、细胞凋亡和衰老表型。计算机分析在许多参与细胞周期调节的基因的 3 素 UTR 中鉴定出 MIR449A 靶序列,其中包括 HDAC1(601241),该基因在癌症中经常过度表达。在报告基因测定中使用 HDAC1 3-prime UTR 确定 HDAC1 是 MIR449A 的直接靶标。此外,Noonan et al.(2009)证明MIR449A部分通过抑制HDAC1的表达来调节前列腺癌细胞的生长和活力。
Mir34/Mir449家族由3个基因组位点的6个同源miRNA组成:Mir34a(611172)、Mir34b(611374)、Mir34c(611375)、Mir449a、Mir449b和Mir449c。Song et al.(2014)报道,所有 Mir34/Mir449 家族 miRNA 缺陷的小鼠表现出产后死亡、不育以及粘膜纤毛清除缺陷导致的严重呼吸功能障碍。在小鼠和非洲爪蟾中,由于基体成熟和顶端对接缺陷,Mir34/Mir449缺陷的多纤毛细胞表现出纤毛长度和数量显着减少。Mir34/Mir449 对纤毛发生的影响至少部分是通过 Cp110(609544)(一种抑制纤毛组装的中心粒蛋白)的转录后抑制介导的。与此一致的是,Mir34/Mir449 缺陷的多纤毛细胞中的 Cp110 敲低通过挽救基体成熟和对接来恢复纤毛发生。Song et al.(2014)得出结论,他们的发现阐明了 Mir34/Mir449 调节运动纤毛发生的保守细胞和分子机制。
▼ 基因结构
Yang等人(2009)在MIR449A、MIR449B及其宿主基因CDC20B的共同启动子区域鉴定了2个功能性E2F1结合位点。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Yang等(2009)将MIR449A和MIR449B基因定位于染色体5上CDC20B基因的内含子1内。Noonan等(2009)报道MIR449A基因定位于染色体5q11.2。