锌指蛋白 644; ZNF644
HGNC 批准基因符号:ZNF644
细胞遗传学定位:1p22.2 基因组坐标(GRCh38):1:90,915,304-91,022,035(来自 NCBI)
▼ 说明
ZNF644是G9A(EHMT2)的组成部分;604599)/GLP(EHMT1;607001)复合物,介导组蛋白H3(见602810)lys9(H3K9)的单二甲基化和二甲基化(Bian et al., 2015)。
▼ 克隆与表达
Shi等(2011)通过外显子组测序,鉴定出ZNF644为常染色体显性高度近视汉族家族中的突变基因。他们表示,ZNF644 含有 7 个 C2H2 Kruppel 型锌指,表明它具有转录因子的功能。RT-PCR 分析检测到 ZNF644 在人类肝脏、胎盘、视网膜和视网膜色素上皮(唯一检测的组织)中表达。
▼ 基因结构
Shi等(2011)确定ZNF644基因含有6个外显子。外显子 1 以及部分外显子 2 和 6 是未翻译的。
▼ 测绘
Shi等(2011)通过基因组序列分析,将ZNF644基因定位到染色体1p22.2。
▼ 基因功能
Bian et al.(2015)利用质谱技术鉴定出ZNF644和WIZ(619715)是293T细胞中G9A/GLP复合物的子单元。ZNF644的N端和WIZ的C端分别通过G9A和GLP的转录激活结构域与复合物相互作用。ZNF644 和 WIZ 与染色质结合并促进 G9A/GLP 复合物在染色质上的定位。染色质免疫沉淀测序分析表明,WIZ 和 ZNF644 与特定位点启动子区域的 G9A 相关,并将 G9A 和 GLP 靶向基因组位点进行转录抑制。
▼ 分子遗传学
通过外显子组测序和分离分析,在一个5代汉族家族中分离出常染色体显性高度近视(MYP21; Shi et al.(2011)在ZNF644基因中发现了一个错义突变(S672G;614167)。614159.0001)受影响的家庭成员。对另外 300 名不相关的散发性汉族高度近视患者的 ZNF644 分析显示,11 名患者分别存在 5 个杂合突变(参见例如 614159.0002-614159.0003),而在 600 名种族匹配的对照中未发现这些突变。
Tran-Viet 等人(2012)通过 Sanger 测序,对 131 名美国高度近视患者的 ZNF644 基因突变进行了筛查。他们在两个个体中,一个是白种人,另一个是非裔美国人,鉴定出了杂合突变(分别为 c.725C-T、T242M 和 c.821A-T、E274V、NM_201269.1)。这两种突变都位于外显子 3 的保守区域,Shi 等人(2011)在中国高度近视患者中发现了该区域的突变。分别在 1,344 个和 100 个种族匹配的染色体中未发现这些变异;然而,由于两人都没有其他家庭成员,因此无法进行隔离分析。
▼ 等位基因变异体(3个精选例子):
.0001 近视 21,常染色体显性遗传
ZNF644、SER672GLY
一个5代汉族高度近视家庭的受影响成员(MYP21;614167),Shi et al.(2011)鉴定了ZNF644基因外显子3中2156A-G转变的杂合性,导致ser672到gly(S672G)的取代。在 600 个种族匹配的对照中没有发现这种突变。
.0002 近视 21,常染色体显性遗传
ZNF644、ILE587VAL
5例无亲属关系的散发性汉族高度近视患者(MYP21;614167),Shi et al.(2011)鉴定了ZNF644基因外显子3中2091A-G转变的杂合性,导致ile587到val(I587V)的取代。在 600 个种族匹配的对照中没有发现这种突变。这些患者的眼底呈老虎状或棋盘状外观,部分患者可见近视圆锥;1 人双侧有福克斯斑点。
.0003 近视 21,常染色体显性遗传
ZNF644,+592G-A,3-PRIME UTR
2例无血缘关系的散发性汉族高度近视患者(MYP21;614167),Shi et al.(2011)鉴定了ZNF644基因3-prime非翻译区(UTR)+592位点GA转换的杂合性。在 600 个种族匹配的对照中没有发现这种突变。这些患者的眼底呈老虎状或棋盘状外观,还可见近视圆锥。