RAS 相关 C3 肉毒毒素底物 3;RAC3
RHO 家族,小 GTP 结合蛋白 RAC3
HGNC 批准的基因符号:RAC3
细胞遗传学定位:17q25.3 基因组坐标(GRCh38):17:82,031,678-82,034,204(来自 NCBI)
▼ 说明
小G蛋白RAC1(602048)、RAC2(602049)和RAC3是与RAS蛋白的RHO亚家族高度相关的GTPase b伸蛋白g(参见190020)(Haataja等人总结,1997)。
▼ 克隆与表达
Haataja等人(1997)分离出RAC家族成员RAC3。RAC3 与 RAC1 和 RAC2 分别具有 92% 和 89% 的氨基酸同一性,但在 C 末端与 RAC1 和 RAC2 不同,C 末端是与亚细胞定位和与特定细胞调节因子结合相关的结构域。RAC3 mRNA 表达模式不同于造血细胞特异性的 RAC2,也不同于 RAC1。
▼ 基因结构
Morris等人(2000)确定了RAC3基因的基因组结构。该基因含有6个外显子。
▼ 测绘
Haataja et al.(1997)通过体细胞杂种和染色体17区域图谱研究将RAC3基因定位到17q23-q25。Courjal et al.(1997)通过荧光原位定位将RAC3基因定位到17q24-qter杂交。Morris等(2000)通过中期和间期FISH分析将RAC3基因定位于17q25.3。
▼ 分子遗传学
一名患有神经发育障碍、大脑结构异常和面容畸形的女孩(NEDBAF;White et al.(2018)在RAC3基因中发现了一个新的杂合错义突变(A59G;618577)。602050.0001)。通过外显子组测序发现该突变,并通过桑格测序证实;没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。
Costain等人(2019)在5名NEDBAF患者(包括2名半同胞)中鉴定出RAC3基因杂合错义突变(602050.0002-602050.0004)。这些突变在 3 名患者中从头发生,并被怀疑是由受影响的半同胞的母体性腺嵌合引起的。这些突变是通过外显子组测序发现的,但在 gnomAD 数据库中并不存在。尚未进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但作者推测由于组成型激活和异常 GTPase 信号传导而产生毒性功能获得效应。
Scala 等(2022)在 10 名无关的 NEDBAF 患者中发现了 RAC3 基因杂合突变,其中包括 White 等(2018)最初报道的 NEDBAF 患者。鉴定出八个单独的突变(例如,参见 602050.0004-602050.0008),并且所有突变均显示为从头突变。当带有每种突变的 RAC3 在原代小鼠海马神经元培养物中表达时,与对照组相比,神经元表现出较少的神经突表达和细胞体变圆。在具有每个突变的重组RAC3中测试GDP/GTP交换率和GTP水解活性。与野生型相比,E62del、D63N、Y64C、K116N突变体导致GDP/GTP交换活性更高,但Y64C和K116N突变体的GTP水解活性与野生型相似,而E62del突变体的水解活性低于野生型。与野生型相比,G12R、A59G、E62K突变导致相似的GDP/GTP交换活性,但与野生型相比,G12R和A59G突变体抑制了GTP水解活性。与野生型相比,G60D 突变导致 GDP/GTP 交换活性较低,GTP 水解率较低。Scala 等人(2022)得出结论,突变体之间的生化差异会不同程度地调节体内 RAC3 功能,并可能产生相关的临床影响。
▼ 动物模型
Corbetta et al.(2009)由于Rac1 -/- 小鼠的致死性,通过有条件地删除Rac3 -/- 小鼠神经元中的Rac1,产生了Rac1 和Rac3 双敲除小鼠。双敲除小鼠比对照组小,但脑重量正常。双基因敲除小鼠出现神经系统异常并伴有自发性癫痫发作,并在出生后第 13 天左右死亡。突变小鼠的大脑显示出背侧海马门的特定缺陷,这与海马回路形成的改变有关。海马培养物分析表明,Rac1 和 Rac3 在树突棘的形成中发挥协同作用,因此,缺乏 Rac1 和 Rac3 的神经元中树突棘的形成受到严重阻碍。
Vaghi等人(2014)通过分析Rac1和Rac3双敲除小鼠,证明Rac1和Rac3是皮质和海马GABA能中间神经元发育所必需的,因为海马和皮质中小白蛋白(PV)阳性细胞的数量减少突变小鼠。Rac1 和 Rac3 的缺失也会导致 PV 阳性中间神经元的成熟缺陷,表明 Rac1 和 Rac3 也是海马和皮质抑制回路发育所必需的。皮质迁移中间神经元数量的减少及其形态的改变表明 Rac1 和 Rac3 在调节皮质中间神经元的运动中发挥作用,从而干扰它们的最终定位。此外,虽然锥体神经元的电生理被动和主动特性(包括膜容量、静息电位、尖峰幅度和持续时间)均正常,但这些细胞在突变小鼠中表现出自发抑制电流减少和兴奋性增加。
Scala et al.(2022)研究了位于switch II区域的4个RAC3突变对NEDBAF患者的影响(Q61L, 602050.0002; E62del,602050.0006;D63N,602050.0005;Y64C, 602050.0007)在小鼠胚胎中。在胚胎第 14.5 天,将具有 4 种突变的 RAC3 电穿孔至大脑的脑室区。每个RAC3突变都会导致异常的神经元迁移,转染的神经元保留在心室和心室下区以及中间区。Scala et al.(2022)得出结论:RAC3在神经元迁移中发挥着关键作用。
▼ 等位基因变异体(8个精选示例):
.0001 伴有大脑结构异常和面部畸形的神经发育障碍
RAC3、ALA59GLY
一名女孩(BAB8740)患有神经发育障碍,伴有大脑结构异常和面容畸形(NEDBAF;618577),White et al.(2018)在RAC3基因中发现了一个从头杂合的c.176C-G颠换(c.176C-G, NM_005052.2),导致ala59到gly(A59G)的取代。该突变是通过外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。
.0002 伴有大脑结构异常和面部畸形的神经发育障碍
RAC3、GLN61LEU
一名 17 岁白种人后裔(I 族)男孩患有神经发育障碍,伴有大脑结构异常和面容畸形(NEDBAF;618577),Costain et al.(2019)在RAC3基因中发现了一个从头杂合的c.182A-T颠换(c.182A-T, NM_005052.2),导致gln61-to-leu(Q61L)替换保守的残基。该突变是通过外显子组测序发现的,但在 gnomAD 数据库中并不存在。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。
.0003 伴有大脑结构异常和面部畸形的神经发育障碍
RAC3、PRO29LEU
一名 5 岁白种人后裔(家族 II)男孩患有神经发育障碍,伴有大脑结构异常和面容畸形(NEDBAF;618577),Costin et al.(2019)在RAC3基因中发现了一个从头杂合的c.86C-T转变(c.86C-T, NM_005052.2),导致pro29到leu(P29L)的取代保守的残基。该突变是通过外显子组测序发现的,但在 gnomAD 数据库中并不存在。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。
.0004 伴有大脑结构异常和面部畸形的神经发育障碍
RAC3、GLU62LYS
一名 5 岁白人后裔男孩(家庭 III)和 2 个半同胞(家庭 IV)患有神经发育障碍,伴有大脑结构异常和面容畸形(NEDBAF;618577),Costain et al.(2019)在RAC3基因中发现了一个杂合的c.184G-A转换(c.184G-A, NM_005052.2),导致保守的位置被glu62-to-lys(E62K)取代。残留物。该突变是通过外显子组测序发现的,但在 gnomAD 数据库中并不存在。该突变在来自家庭 III 的受影响儿童中重新发生,并被怀疑是来自家庭 IV 的未受影响母亲的性腺嵌合体。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。
Scala 等人(2022)在一名 NEDBAF 患者(患者 7)中鉴定出 RAC3 基因中 E62K 突变的杂合性。该突变是通过对 480 个与智力障碍相关的基因进行新一代测序而鉴定的。该突变在父亲中不存在,并且无法在母亲中进行测试,因为该患者是通过卵子捐赠者受孕的。当具有 E62K 突变的 RAC3 在原代小鼠海马神经元培养物中表达时,与对照组相比,神经元表现出较少的神经突表达和细胞体变圆。
.0005 伴有大脑结构异常和面部畸形的神经发育障碍
RAC3、ASP63ASN
2 名不相关的患者(患者 1 和患者 9)患有神经发育障碍,伴有大脑结构异常和面容畸形(NEDBAF;618577),Scala et al.(2022)鉴定了RAC3基因中的从头c.187G-A转换(c.187G-A, NM_005052.3)的杂合性,导致asp63到asn(D63N)的取代。该突变在 1 号患者中通过三重全外显子组测序鉴定,在 9 号患者中通过单组全外显子组测序鉴定,并通过桑格测序在两名患者中得到证实。当具有 D63N 突变的 RAC3 在原代小鼠海马神经元培养物中表达时,与对照组相比,神经元表现出较少的神经突表达和细胞体变圆。
.0006 伴有大脑结构异常和面部畸形的神经发育障碍
RAC3、3-BP DEL、186GGA
一名患有神经发育障碍并伴有脑结构异常和面容畸形的患者(患者 2)(NEDBAF;618577),Scala et al.(2022)鉴定出RAC3基因中的从头3-bp缺失(c.186_188delGGA,NM_005052.3)杂合性,导致Glu62(E62del)缺失。该突变通过三重全外显子组测序进行鉴定,并通过桑格测序进行确认。当带有 E62del 突变的 RAC3 在原代小鼠海马神经元培养物中表达时,与对照组相比,神经元表现出较少的神经突表达和细胞体变圆。与野生型相比,具有 E62del 突变的重组 RAC3 具有较高的 GTP/GDP 交换率,但 GTP 水解率较低。
.0007 伴有大脑结构异常和面部畸形的神经发育障碍
RAC3、TYR64CYS
患有神经发育障碍并伴有脑结构异常和面容畸形的患者(患者 3)(NEDBAF;618577),Scala et al.(2022)鉴定了RAC3基因中从头c.191A-G转变(c.191A-G, NM_005052.3)的杂合性,导致tyr64-to-cys(Y64C)取代。该突变通过三重全外显子组测序进行鉴定,并通过桑格测序进行确认。当带有 Y64C 突变的 RAC3 在原代小鼠海马神经元培养物中表达时,与对照组相比,神经元表现出较少的神经突表达和细胞体变圆。与野生型相比,具有 Y64C 突变的重组 RAC3 具有更高的 GTP/GDP 交换率。
.0008 伴有大脑结构异常和面部畸形的神经发育障碍
RAC3、GLY12ARG
2 名不相关的患者(患者 5 和患者 10)患有神经发育障碍,伴有大脑结构异常和面容畸形(NEDBAF;618577),Scala et al.(2022)鉴定了RAC3基因中的从头c.34G-C颠换(c.34G-C, NM_005052.3)的杂合性,导致gly12到arg(G12R)的取代。该突变通过三重全外显子组测序进行鉴定,并通过桑格测序进行确认。当具有 G12R 突变的 RAC3 在原代小鼠海马神经元培养物中表达时,与对照组相比,神经元表现出较少的神经突表达和细胞体变圆。