长基因间非编码 RNA 1080; LINC01080
lncRNA TCONS_00021856
长基因间非编码 RNA TCONS_00021856
lincRNA TCONS_00021856
TCONS_00021856
HGNC 批准的基因符号:LINC01080
细胞遗传学定位:13q31.1 基因组坐标(GRCh38):13:80,011,077-80,026,663(来自 NCBI)
▼ 说明
长基因间非编码RNA(lincRNA),如TCONS_00021856,是超过200个核苷酸的具有多种功能的非编码RNA(Chen et al., 2013)。
▼ 克隆与表达
Chen等人(2013)通过在lincRNA数据库中搜索低密度SNP的lincRNA,鉴定出757个核苷酸的lincRNA TCONS_00021856。EST数据库分析表明TCONS_00021856在大脑中高度富集。作者在黑猩猩、大猩猩、猩猩、长臂猿、恒河猴和狨猴中发现了 TCONS_00021856 的直系同源物,但在其他物种中没有发现。
▼ 基因结构
Chen et al.(2013)确定TCONS_00021856基因有2个外显子,跨度148 kb。
▼ 测绘
Gross(2013)根据TCONS_00021856(Chen et al., 2013)第一个外显子与基因组序列(GRCh37)匹配的EST(GenBank DA225206)比对,将TCONS_00021856基因对应到染色体13q31.1。