VPS39 啤酒花复合物子单元；VPS39

液泡蛋白分选 39，酵母，同源物
VAM6，酵母，同源物；VAM6
TRAP1 样蛋白；TLP
KIAA0770

HGNC 批准的基因符号：VPS39

细胞遗传学定位：15q15.1 基因组坐标（GRCh38）：15:42,158,701-42,208,304（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

Nagase 等人（1998）通过对从大小分级的脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序，克隆了 VPS39，他们将其称为 KIAA0770。推导的蛋白质含有731个氨基酸，与酿酒酵母Vps39具有显着的同源性。RT-PCR ELISA显示VPS39普遍表达，其中在卵巢中表达最高，其次是心脏、脑、肺、睾丸和肾脏。肝脏、骨骼肌、胰腺和脾脏中的表达更为中等。

Caplan等人（2001）通过在数据库中搜索酿酒酵母Vam6/Vps39的同源物，然后通过5-prime RACE和心脑cDNA文库的PCR，克隆了人类VPS39，他们将其命名为VAM6。推导的886个氨基酸的蛋白质的计算分子量超过100 kD。它与酿酒酵母 Vam6 的 C 端一半有 26% 的同一性，与 TRAP1（TGFBRAP1）有 21% 的同一性；606237），酿酒酵母Vam6的另一种人类同源物。人VAM6具有N端香子（见605629）同源（CNH）结构域和中央网格蛋白重链（CLTC；118955）重复同源（CLH）结构域。CNH 和 CLH 结构域在人类 TRAP1 以及果蝇、线虫和粟酒裂殖酵母 Vam6 中是保守的，但酿酒酵母 Vam6 缺乏 CNH 结构域。Northern 印迹分析揭示了 VAM6 在人体组织中的普遍表达。

通过在数据库中搜索TRAP1的同源物，然后通过肝癌细胞系cDNA文库的5-prime RACE，Felici等人（2003）克隆了VPS39，他们将其称为TLP。推导的 875 个氨基酸的 TLP 蛋白与 Caplan 等人（2001）报道的 VAM6 蛋白相同，除了 VAM6 中 val46 之后插入了 11 个氨基酸。Northern 印迹分析在所有检查的组织中检测到 5.5 kb 的转录物，其中在脑、心脏、骨骼肌、肾脏和脾脏中表达最高。5.8 kb 的第二个转录物存在于外周血白细胞中。

▼ 基因功能

Caplan等人（2001）发现HeLa细胞中VAM6的过度表达导致溶酶体和晚期内体大量聚集并融合成大的核旁结构，这让人想起表达组成型活性RAB7（602298）所引起的效应。然而，VAM6 在显性失活 RAB7 存在的情况下发挥作用，表明它在 RAB7 下游或孤立发挥作用。梯度分级分离、2-杂交和免疫共沉淀分析表明 VAM6 形成同源寡聚物。VAM6 的 CLH 结构域是同源寡聚化所必需的，并且 CNH 和 CLH 结构域都是诱导溶酶体聚类和融合所必需的。Caplan等人（2001）得出结论，VAM6是参与溶酶体融合的束缚/对接因子。

Felici等人（2003）通过对转染的COS-1细胞和人角质形成细胞内源蛋白的免疫沉淀分析发现，TLP与活性和激酶缺陷的TGF-β受体-2（TGFBR2；TGFBR2）相关。190182）和激活素受体2B（ACVR2B；602730）。TLP 也与 SMAD4（600993）相互作用，但仅在 TGFB（190180）/activin（参见 147390）信号存在的情况下。TLP 以不依赖配体的方式与 TGFB 受体复合物共定位于质膜和膜下囊泡结构域。在几种人类细胞系中，TLP 的过表达抑制了 TGFB 诱导的 SMAD3（603109）/SMAD4 特异性报告基因的转录，同时增强了 TGFB 诱导的 SMAD2（601366）/SMAD4 特异性报告基因的转录。TLP 抑制 SMAD3/SMAD4 复合物的形成，而不影响 SMAD3 磷酸化，并且对 SMAD2 磷酸化或异源寡聚化没有影响。Felici et al.（2003）提出TLP通过将SMAD4定位在细胞内来调节SMAD2和SMAD3信号的平衡，从而有助于TGFB转录反应的细胞特异性。

▼ 测绘

Gross（2017）根据VPS39序列（GenBank AF281052）与基因组序列（GRCh38）的比对，将VPS39基因定位到染色体15q15.1。