核糖体蛋白 S28; RPS28

HGNC 批准基因符号:RPS28

细胞遗传学定位:19p13.2 基因组坐标(GRCh38):19:8,321,496-8,323,340(来自 NCBI)

▼ 说明

RPS28基因编码可能参与核糖体生物发生的核糖体蛋白(Gripp等人总结,2014)。哺乳动物核糖体由 4 种 RNA(参见 180450)和大约 80 种不同的蛋白质组成。

▼ 克隆与表达

Chan等人(1991)克隆并鉴定了大鼠核糖体蛋白S28(Rps28)cDNA。他们将人类RPS28 cDNA的序列存入GenBank(L05091)。

▼ 测绘

Kenmochi等人(1998)通过体细胞杂交和辐射杂交作图分析,将人类RPS28基因定位到19p13.2(GenBank AB007164)。

▼ 基因功能

转移RNA衍生的小RNA(tsRNAs;也称为 tRNA 衍生片段)是一类丰富的小非编码 RNA。Kim 等人(2017)表明,抑制特定的 tsRNA LeuCAG-3-prime-tsRNA 可诱导体外快速分裂细胞和小鼠原位肝细胞癌模型中的细胞凋亡。该tsRNA结合至少2个核糖体蛋白mRNA(RPS28和RPS15, 180535)以增强它们的转录。RPS28 mRNA 转录的减少会阻断前 18S 核糖体 RNA 加工,导致 40S 核糖体子单元数量减少。Kim等人(2017)得出的结论是,他们的数据建立了一种转录后机制,可以在不同的生理状态下微调基因表达,并为治疗癌症提供了潜在的靶点。

▼ 分子遗传学

2名无血缘关系的女孩患有Diamond-Blackfan贫血15和下颌面骨发育不全(DBA15;Gripp et al.(2014)鉴定出影响 RPS28 基因起始密码子(c.1A-G;c.1A-G;603685.0001),预计会导致单倍体不足。尚未对该变体进行功能研究,但 Gripp 等人(2014)指出,RPS28 与其他 RPS 蛋白相互作用生成核糖体,并且该突变可能与 RPS19(603474)的缺失相当,RPS19 在 DBA1 中突变(105650)。

▼ 等位基因变异体(1个精选示例):

.0001 DIAMOND-BLACKFAN 贫血 15 伴有下颌面发育不全

RPS28、MET1VAL

2名无血缘关系的女孩(患者4和患者5)患有Diamond-Blackfan贫血15和下颌面骨发育不全(DBA15;606164),Gripp et al.(2014)鉴定出相同的从头杂合c.1A-G转变影响RPS28基因的起始密码子(met1到val),预计会导致单倍体不足。通过对候选核糖体蛋白基因进行测序发现了该突变。其中一名患者外周血细胞中突变等位基因和 19p 上的 SNP 缺失,但口腔 DNA 中没有,而另一名患者仅口腔 DNA 中 19p 上突变等位基因和 SNP 缺失。目前尚不清楚这种组织特异性等位基因失衡是否导致了临床表现。

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