泛素特异性蛋白酶 39; USP39
snRNP 组装缺陷 1,酿酒酵母,同源物; SAD1
HGNC 批准的基因符号:USP39
细胞遗传学定位:2p11.2 基因组坐标(GRCh38):2:85,602,861-85,649,283(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Lygerou 等人(1999)在酿酒酵母中设计了一种筛选方法,以鉴定阻止 U4 snRNA 组装成功能性 snRNP 的突变体。他们鉴定出一种 snRNP 组装缺陷突变体,sad1-1。Lygerou等人(1999)利用基因组文库对sad1-1细胞进行互补,克隆了酵母Sad1。EST 数据库分析在人类、小鼠、果蝇和线虫中鉴定出 Sad1 同源物,并且 N 末端核定位信号和推定的锌指具有显着的保守性。
Makarova et al.(2001)通过纯化HeLa细胞U4/U6.U5 tri-snRNPs的SDS-PAGE,然后进行EST数据库分析,鉴定出了USP39。推导的 565 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 65.4 kD。N端结构域富含精氨酸、丝氨酸和谷氨酸,类似于SR相关蛋白的RS结构域,如SNRP70(180740)和RY1。USP39还包含一个中心锌指和2个泛素C端水解酶(UCH)结构域。USP39 与酵母 Sad1 具有 65% 的氨基酸相似性。
▼ 基因功能
Lygerou等人(1999)确定温度敏感突变体sad1-1阻止了新合成的U4 snRNA在U4/U6复合物中的组装,并且还赋予剪接缺陷。该突变体中含有内含子的报告基因的剪接减少了 10 倍以上。Lygerou等人(1999)通过四分体分析表明Sad1对于细胞活力至关重要。免疫沉淀和免疫定位研究表明Sad1定位于细胞核并且不与snRNP蛋白稳定结合。
Makarova et al.(2001)表明,增加抗USP39抗体的量会导致未剪接的前mRNA的积累,表明USP39在前mRNA剪接中发挥作用。USP39 的免疫耗竭强烈抑制剪接。盐浓度增加时的免疫沉淀表明,USP39 对于 U4/U6.U5 tri-snRNP 的稳定性不是必需的,但对于将 tri-snRNP 募集到前剪接体至关重要。