富含天冬氨酸尾部的单程膜蛋白 1; SMDT1
基本的 MCU 稳压器;EMRE
染色体 22 开放解读码组 32; C22ORF32
HGNC 批准的基因符号:SMDT1
细胞遗传学定位:22q13.2 基因组坐标(GRCh38):22:42,079,700-42,084,284(来自 NCBI)
▼ 说明
SMDT1 是线粒体单向转运蛋白的重要子单元,是线粒体内膜的多子单元钙通道(Sancak et al., 2013)。
▼ 克隆与表达
Sancak等人(2013)利用质谱和数据库分析从HEK293T和HeLa细胞中鉴定出与线粒体钙输入蛋白MCU(614197)共纯化的蛋白质,鉴定出了SMDT1,他们将其称为EMRE。推导的 108 个氨基酸蛋白具有 N 端线粒体靶向信号,随后是跨膜结构域和保守的富含天冬氨酸的 C 端结构域。数据库分析揭示了 Emre 在所有 20 个小鼠组织中的表达。表达在胃、小肠和大肠、肾、心脏和棕色脂肪组织中最高,在脾、睾丸和胎盘中表达最低。通过 SDS-PAGE 检测,EMRE 的表观分子量约为 10 kD。数据库分析揭示了 EMRE 的直系同源物仅存在于后生动物中。
▼ 基因功能
Sancak等人(2013)发现通过RNA干扰敲除人类细胞系中的EMRE会导致线粒体钙摄取缺陷,但对其他线粒体参数没有影响。EMRE 的敲低还将线粒体钙单向转运蛋白的表观大小从约 480 kD 降低至约 300 kD。MCU调控子单元MICU1(605084)的敲低对单向转运蛋白的大小也有类似的影响。EMRE 的丢失特别消除了 MCU 与 MICU1 和 MICU2(610632)(MICU1 旁系同源物和结合伴侣)的关联。Sancak等人(2013)提出了一种模型,EMRE与线粒体内膜空间中的MICU1和MICU2以及内膜中的寡聚MCU相互作用,从而将MICU1和MICU2的钙敏感活性与MCU的钙通道活性联系起来。
Konig et al.(2016)发现,小鼠Maip1(617267)与线粒体基质AAA(m-AAA)蛋白酶子单元Afg3l2(604581)相互作用,并与Afg3l1(603020)、Afg3l2和Spg7(602783)共迁移。大约2.3-MDa复合物。HeLa 细胞中 AFG3L2、SPG7 或 MAIP1 的敲除显着降低了 EMRE 前体形式的水平,EMRE 是 MCU 复合体的重要子单元。MAIP1 直接与 EMRE 相互作用,似乎可以保护未组装的 EMRE 前体免受 YME1L1(607472)的蛋白水解降解。相比之下,m-AAA 蛋白酶以孤立于 MAIP1 的方式降解未组装的 EMRE,从而调节大约 400-kD MCU 复合物的形成。m-AAA蛋白酶活性的丧失扰乱了小鼠神经元线粒体中神经元MCU的组装,解除了HeLa细胞中线粒体Ca(2+)通量的调节,并使胚胎小鼠神经元对线粒体通透性转换孔开放和MCU依赖性Ca(2+)敏感)-诱导细胞死亡。
▼ 测绘
Hartz(2014)根据SMDT1序列(GenBank CR456453)与基因组序列(GRCh37)的比对,将SMDT1基因定位到染色体22q13.2。