TAM41 线粒体转运蛋白组装和维护同源物;TAMM41
转运子组装和维护,线粒体,酿酒酵母,同源物
TAM41
染色体 3 开放解读码组 31; C3ORF31
HGNC 批准的基因符号:TAMM41
细胞遗传学定位:3p25.2 基因组坐标(GRCh38):3:11,721,896-11,846,885(来自 NCBI)
▼ 说明
在酵母中,Tamm41对于Tim23(TIMM23;)的完整性和活性是必需的。605034)和Tim22(TIMM22; 607251)线粒体蛋白输入复合物并用于合成线粒体心磷脂,一种二聚磷脂(Kutik 等人总结,2008)。
▼ 克隆与表达
通过在数据库中搜索与酵母 Tam41 相似的序列,Tamura 等人(2006)在包括人类在内的多个物种中鉴定出了直向同源物。人类 TAMM41(他们称之为 TAM41)含有 316 个氨基酸,预计会靶向线粒体。在酵母中,Tam41 定位于线粒体内膜。
▼ 基因功能
Tamura 等人(2006)发现,酵母中 Tam41 的破坏会导致生长和通过 Tim23 易位复合物输入线粒体内蛋白的温度敏感缺陷。Tam41 并未与 Tim23 复合物稳定结合,但其耗尽导致 Tim23 复合物部分解离。Gallas 等人(2006)孤立地确定了酵母 Tam41(他们称之为 Mmp37)是线粒体蛋白输入所必需的。
Kutik et al.(2008)发现酵母中Tam41的缺失对线粒体Tim22蛋白输入复合物的组装产生比Tim23复合物组装更严重的影响。此外,缺乏 Tam41 的酵母中呼吸链超复合物和线粒体内膜电位受损,类似于缺乏心磷脂合酶的线粒体。Kutik等人(2008)证实,Tam41缺失导致线粒体中磷脂酸(心磷脂生物合成中的第一个代谢物)含量增加,并且磷脂酰甘油和大多数心磷脂实际上缺失。
▼ 测绘
Hartz(2012)根据TAMM41序列(GenBank AK092776)与基因组序列(GRCh37)的比对,将TAMM41基因定位到染色体3p25.2。
▼ 分子遗传学
3名无血缘关系的合并氧化磷酸化缺陷患者-56(COXPD56;620139),Thompson et al.(2022)鉴定出TAMM41基因的复合杂合突变(614948.0001-614948.0006)。这些突变是通过患者 1 和 3 的全外显子组测序以及患者 2 的全基因组测序发现的。患者 1 和 2 的肌肉组织中 TAMM41 蛋白水平降低。酿酒酵母 Tamm41 基因具有突变 Y209C、P236L、或K186P,对应于患者中发现的3个错义突变中的每一个(P137L,614948.0001;Y110C,614948.0005;和S86P,614948.0003)未能弥补Tamm41缺陷的酿酒酵母菌株的生长缺陷。在患者1和患者2的肌肉组织中,多种氧化磷酸化子单元严重减少;然而,在患者 1 的成纤维细胞中,仅发现 NDUFB8(602140)和 COX1(176805)轻度下降,而患者 2 和 3 的成纤维细胞中未发现异常。患者肌肉组织中的总心磷脂和磷脂酰甘油下降,但没有变化。在患者的成纤维细胞中。基于这些结果,Thompson 等人(2022)得出结论,TAMM41 缺陷存在组织特异性影响。
▼ 等位基因变异体(6个精选例子):
.0001 联合氧化磷酸化缺陷 56
TAMM41、PRO137LEU(rs775491404)
合并氧化磷酸化缺陷56(COXPD56;COXPD56;)的患者(患者1)620139),Thompson et al.(2022)鉴定出TAMM41基因中的复合杂合突变:c.410C-T转换(c.410C-T, NM_001284401.1),导致pro137到leu(P137L)的取代,以及内含子5中的c.709-2A-G转变(614948.0002),预计会影响剪接受体位点。这些突变是通过三重全外显子组测序鉴定出来的,并通过桑格测序证实,这些突变与家族中的疾病分开。患者肌肉组织中的 TAMM41 蛋白水平降低。
.0002 联合氧化磷酸化缺陷 56
TAMM41、IVS5、AG、-2(rs934260435)
用于讨论 TAMM41 基因内含子 5 中的 c.709-2A-G 转变(c.709-2A-G, NM_001284401.1),该基因在合并氧化磷酸化的患者(患者 1)中被鉴定为复合杂合状态缺乏症56(COXPD56;Thompson 等人(2022),参见 620139),参见 614948.0001。
.0003 联合氧化磷酸化缺陷 56
TAMM41、SER86PRO(rs199871047)
合并氧化磷酸化缺陷56(COXPD56;COXPD56;)的患者(患者2)620139),Thompson et al.(2022)鉴定出TAMM41基因中的复合杂合突变:c.256T-C转换(c.256T-C, NM_001284401.1),导致ser86到pro(S86P)的取代,以及内含子3中的c.411+1G-T颠换(614948.0004),预计会影响剪接。这些突变是通过三重全基因组测序鉴定出来的,并通过桑格测序证实,并与家族中的疾病分开。患者肌肉组织中的 TAMM41 蛋白水平降低。
.0004 联合氧化磷酸化缺陷 56
TAMM41、IVS3、GT、+1(rs780204589)
讨论 TAMM41 基因内含子 3 中的 c.411+1G-T 颠换(c.411+1G-T, NM_001284401.1),预计会影响剪接,在患者复合杂合状态下被鉴定(患者) 2)合并氧化磷酸化缺陷56(COXPD56;Thompson 等人(2022),参见 620139),参见 614948.0003。
.0005 联合氧化磷酸化缺陷 56
TAMM41、TYR110CYS
合并氧化磷酸化缺陷56(COXPD56;COXPD56;)的患者(患者3)620139),Thompson et al.(2022)鉴定了TAMM41基因突变的复合杂合性:c.329A-G转变(c.329A-G, NM_001284401.1),导致tyr110-to-cys(Y110C)替换和1-bp重复(c.806dup; 614948.0006),导致移码和提前终止(Asn269LysfsTer14)。这些突变是通过三重全外显子组测序鉴定出来的,并通过桑格测序证实,这些突变与家族中的疾病分开。
.0006 联合氧化磷酸化缺陷 56
TAMM41、1-BP DUP、NT806(rs768826552)
讨论 TAMM41 基因中的 1-bp 重复(c.806dup,NM_001284401.1),预计会导致移码和提前终止(Asn269LysfsTer14),该重复在一名患者(患者 3)的复合杂合状态下被鉴定出联合氧化磷酸化缺陷-56(COXPD56;Thompson 等人(2022),参见 620139),参见 614948.0005。