锌指蛋白 658; ZNF658
HGNC 批准基因符号:ZNF658
细胞遗传学定位:9q21.11 基因组坐标(GRCh38):9:66,900,725-66,932,141(来自 NCBI)
▼ 说明
ZNF658 是一种锌依赖性转录调节因子,可与回文 DNA 结合,在参与锌稳态的基因启动子区域形成锌转录调节元件(ZTRE)。ZNF658 似乎还通过 45S rRNA 前体中的簇状 ZTRE 来调节 rRNA 生物合成,这是一个高度依赖锌的过程(参见 180450)(Ogo 等人总结,2015)。
▼ 克隆与表达
Ogo等人(2015)利用质谱分析鉴定人CaCo-2结肠癌细胞中与锌转运蛋白SLC30A5(607819)启动子区ZTRE结合的蛋白质,鉴定出ZNF658。推导的 1,059 个氨基酸的蛋白质具有 N 端 Kruppel 相关框(KRAB)结构域,随后是 21 个中央和 C 端锌指。
▼ 基因功能
Ogo et al.(2015)发现CaCo-2细胞中siRNA介导的ZNF658敲除增加了3个锌依赖性基因SLC30A5、SLC30A10(611146)和CBWD(见611078)的mRNA表达,并降低了它们对升高的敏感性锌浓度。EMSA揭示ZNF658直接结合SLC30A5启动子区域内的ZTRE。ZNF658 的锌指 12 至 15 和 ZTRE 的两侧都需要进行结合。微阵列分析显示,ZNF658 的敲除还提高了几种核糖体蛋白基因的表达,但降低了由 45S rRNA 前体产生的几种 rRNA 的丰度。测序揭示了 45S rRNA 前体中存在聚集的 ZTRE。Ogo等人(2015)得出结论,ZNF658具有抑制锌稳态相关基因表达和调节rRNA加工的双重作用。
▼ 测绘
Hartz(2015)根据ZNF658序列(GenBank AK024222)与基因组序列(GRCh38)的比对,将ZNF658基因定位到染色体9q21.11。