C 型凝集素结构域家族 2,成员 A;CLEC2A
增殖诱导的淋巴细胞相关受体; PILAR
角质形成细胞相关的 C 型凝集素;KACL
HGNC 批准的基因符号:CLEC2A
细胞遗传学定位:12p13.31 基因组坐标(GRCh38):12:9,877,742-9,932,370(来自 NCBI)
▼ 说明
CLEC2A属于激活诱导的、天然致命物基因复合物编码的C型凝集素样受体的CLEC2家族(Spreu et al., 2007)。
▼ 克隆与表达
Spreu等人(2007)通过数据库分析和前单核细胞白血病细胞系cDNA文库的PCR获得了4个CLEC2A剪接变体的cDNA。主要变体 CLEC2A1 和 CLEC2A2 包含不同的末端外显子(分别为外显子 5A 和 5B),并分别编码预测的 174 个和 160 个氨基酸的蛋白质。两者都包含一个 N 端胞质尾、一个跨膜结构域、一个短茎区和一个具有 3 个潜在 N-糖基化位点的 C 端 C 型凝集素结构域(CTLD)。CLEC2A1 的 CTLD 与其他 CLEC2 蛋白的 CTLD 具有 40% 至 50% 的同一性,而 CLEC2A2 CTLD 的最后 23 个氨基酸与其他 CLEC2 蛋白缺乏同源性。2 个较短的 CLEC2A 变体 sCLEC2A1 和 sCLEC2A2 缺乏编码跨膜结构域的外显子 2,表明它们可能编码可溶性亚型。然而,在转染的293T或COS-7细胞的上清液中未检测到sCLEC2A1和sCLEC2A2。RT-PCR 分析显示 CLEC2A 主要在骨髓细胞系(而非上皮细胞系)以及皮肤和骨髓中表达。FACS 分析显示转染的 293T 和 COS-7 细胞表面有 CLEC2A1 表达,但没有 CLEC2A2。
Huarte等人(2008)通过对染色体12p12-p13上编码含有C型凝集素结构域的蛋白的基因进行序列分析,然后对脾cDNA进行RACE-PCR,克隆了CLEC2A,他们将其命名为PILAR。推导的 174 个氨基酸的蛋白质在其胞外区域包含一个跨膜结构域和一个截短的 C 型凝集素结构域。RT-PCR 分析显示 PILAR 在胸腺、小肠、子宫、睾丸和卵巢中表达。PILAR在B细胞和T细胞中表达,特别是幼稚CD8(见186910)T细胞,但在天然致命物细胞中不表达。
▼ 基因功能
Huarte et al.(2008)利用Western blot和免疫沉淀分析发现PILAR与CD161(KLRB1;KLRB1;CD161)相互作用。602890)。RT-PCR分析表明T细胞活化诱导CD8 T细胞中PILAR的瞬时表达,流式细胞术分析表明PILAR在活化的CD4(186940)T细胞上表达。抗原呈递细胞上 PILAR 表达的增加可通过增强抗凋亡蛋白(例如 BCLXL;BCLXL)的表达来提高存活率,从而增强 T 细胞增殖。600039)以CD161依赖性方式。2 个炎症滑液样本中 7% 至 10% 的 CD4 T 细胞表达 PILAR,这表明 PILAR 在关节炎症发病机制中发挥作用。Huarte et al.(2008)得出结论,PILAR 在调节 T 细胞扩增程度方面具有核心作用。
Martick et al.(2008)表明,啮齿动物Clec2基因的3-prime UTR中存在高活性的锤头核酶。Martick等人(2008)使用锤头RNA基序搜索,对非保守区域进行宽松的界定,检测到核酶序列,其中不变区域与之前识别的连续锤头不同,出现为由数百个核苷酸分隔的2个片段。值得注意的是,片段对可以在 3 素 UTR 内的终止和多腺苷酸化信号之间组装形成活性锤头状核酶结构。Martick et al.(2008)证明,这种锤头结构在体外和体内都可以自裂解,并且能够减少小鼠细胞中的蛋白质表达。Martick et al.(2008)得出的结论是,一种未被认识的转录后基因调控机制,涉及mRNA内不连续核酶序列的关联,可能正在调节几种在骨重建和几种哺乳动物的免疫反应中发挥作用的CLEC2蛋白的表达。
▼ 生化特征
Li et al.(2013)发现人类NKp65(KLRF2;618814)与其配体KACL在纳摩尔范围内结合。NKp65-KACL复合物在3.2埃分辨率下的结构表明NKp65和KACL具有相对较高的结构相似性。NKp65和KACL都采用了其他CTLD的折叠特征,包括2个α螺旋和2个由7条β链组成的反平行β折叠。NKp65 包含 2 个 N 连接糖基化位点 asn67 和 asn202,而 KACL 包含 2 个链内二硫键和 3 个 N 连接糖基化位点 asn78、asn130 和 asn143。他们的NKp65-KACL复合物是由2个NKp65单体和一个KACL同型二聚体组成的四聚体,同型二聚体的每个KACL以相同的方式与NKp65单体结合。两种蛋白质之间的结构相似性提供了复合物界面的高度形状互补性,与界面中的 17 个氢键相结合,使得 NKp65 和 KACL 以极高的亲和力结合。
▼ 基因结构
Spreu等(2007)确定CLEC2A基因包含6个外显子,其中包括2个替代末端外显子(外显子5A和5B),跨度为33.7 kb。
▼ 测绘
Spreu等(2007)通过基因组序列分析,将CLEC2A基因定位到染色体12p13,位于CLEC2B(603242)和CLEC12A(612088)基因之间。Huarte et al.(2008)通过基因组序列分析将CLEC2A基因定位到染色体12p13.31。