含 OTU 结构域的蛋白 7A; OTUD7A
OTUD7
染色体16开放解读码组15;C16ORF15
CEZANNE2
HGNC 批准的基因符号:OTUD7A
细胞遗传学位置:15q13.3 基因组坐标(GRCh38):15:31,475,398-31,870,673(来自 NCBI)
▼ 说明
OTUD7A 基因编码去泛素化酶(DUB;参见 603478) 家族的成员,这些酶是专门从目标降解的蛋白质上裂解泛素(191339) 连接的蛋白酶。OTUD7A 还定位于大脑中的突触后密度,表明在突触发育和成熟中发挥作用(Uddin 等人的总结,2018)。
OTUD7A 属于以卵巢肿瘤(OTU) 结构域为特征的 DUB 亚家族(Kayagaki et al., 2007)。
▼ 克隆与表达
茅垣等人(2007) 在基于小干扰 RNA(siRNA) 的 OTU 去泛素化酶(DUB) 家族成员筛选中鉴定出含有卵巢肿瘤结构域(OTU) 的蛋白 7A(OTUD7A)。3,042 个碱基对的 mRNA 包含一个开放阅读码组(ORF),可预测 926 个氨基酸的蛋白质。除了 OTU 结构域外,该蛋白的羧基末端还包含 A20 样锌指(ZNF A20) 结构域。
乌丁等人(2018) 发现与其他人体组织相比,人脑组织中 OTUD7A 基因的表达量最高。网络分析表明,OTUD7A 基因在大脑特异性蛋白质模块中发挥重要作用,并且可能参与大脑特异性突触信号传导。Otud7a 也在出生后早期树突和树突棘形成时发育中的老鼠大脑中被发现。基因表达以点状模式定位于神经元胞体和树突,并且还显示出定位于兴奋性突触的突触后区域。
在小鼠大脑中,Yin 等人(2018) 发现 Otud7a 在初级皮质神经元中高表达,并在细胞体的树突棘和膜室中富集。
▼ 测绘
OTUD7A 基因对应到染色体 15q13.3(Kayagaki 等,2007)。
▼ 分子遗传学
乌丁等人(2018) 对 6,000 多名患有神经发育障碍但没有 15q13.3 微缺失的个体进行了全基因组或全外显子组测序(参见 15q13.3 缺失综合征,612001),并检测到 8 个新生基因突变断点区间(BP4-BP5),其中3个发生在OTUD7A基因中。Uddin 等人在 2 名患有自闭症谱系障碍(ASD) 的同胞中(先证者为病例 3)(2018) 在 OTUD7A 基因(asn492_lys494del) 中发现了一个从头杂合的 9-bp 框内缺失。体外研究表明,该突变导致突变蛋白产生正常水平,但突变蛋白无法挽救染色体15q13杂合缺失的小鼠神经元的异常树突表型(Df(h15q13)+/-突变体;参见动物模型)。培养的野生型神经元中突变体 OTUD7A 的表达显着缩短了树突棘长度,这与轻微的显性失活效应一致。没有对患者细胞进行研究。乌丁等人(2018) 还鉴定了另外 2 名不相关的 ASD 患者,其与 OTUD7A 基因中的从头杂合内含子变异相关(c.-223+11014A-G 和 c.1150+935del);没有对这些变体进行功能研究,也没有对患者细胞进行研究。
科兹洛娃等人(2022) 对 1,779 名精神分裂症病例和 1,418 名对照者中精神分裂症相关拷贝数变异(CNV) 内的基因进行了靶向测序。他们鉴定出 3 名患者的 OTUD7A 基因具有罕见变异,该基因位于与多种神经精神表型相关的染色体 15q13.3 缺失区间内。没有一个变体达到统计显着性。罕见的变体包括 arg89 至 ter(R89X, rs757148409)、glu136 至 ter(E136X) 和 asn492_lys494del(c.1474_1482del)。Uddin 等人已鉴定出 asn492_lys494del 变体(2018) 两名患有自闭症的同胞。科兹洛娃等人(2022) 通过 CRISPR-Cas9 工程,在人诱导多能干细胞(hiPSC) 衍生的诱导兴奋性神经元(iNs) 中模拟了 OTUD7A 变体 R89X。突变体 iNs 的 OTUD7A 蛋白表达降低了约 50%,而没有经历无义介导的 mRNA 衰减。突变体 iN 还表现出树突复杂性、突触蛋白 GluA1(138248) 和 PSD95(602887) 密度以及神经元网络活性的显着降低。与突变 iN 中的神经元表型一致,转录组分析表明,由于 OTUD7A 功能丧失而下调的基因组丰富了与突触发育和功能相关的基因,并且与精神分裂症和其他神经精神疾病相关。Hamosh(2022) 发现,在 gnomAD 中,asn492_lys494del 变体在南亚人中具有最高的次要等位基因频率(0.0001001, 3/29,964 等位基因),但在 1 名非裔美国人和 3 名非芬兰欧洲人中也发现了这种情况。Hamosh(2022) 在 gnomAD 的 1 名芬兰人和 1 名非芬兰欧洲人中发现了 R89X 变体(rs757148409),等位基因频率为 0.0000080。
▼ 动物模型
费金等人(2014) 发现,具有杂合 15q13.3 微缺失(Df(h15q13)/+) 的突变小鼠在急性癫痫发作检测中表现出神经元兴奋性的显着变化,发生肌阵挛和失神样癫痫发作的倾向增加,但阵挛性癫痫发作的倾向降低和强直性癫痫发作。突变小鼠的长期空间参考记忆受损,海马体和前额皮质的θ频率降低,以及与精神分裂症中观察到的听觉处理缺陷类似。这些小鼠的神经系统异常重现了在 15q13.3 缺失的人类中观察到的一些表型特征。
Uddin 等人使用 RNA 测序(2018) 发现 Df(h15q13)/+ 小鼠与前脑皮质发育相关的几个基因的表达显着降低,包括 Chrna7(118511) 和 Otud7a。与野生型相比,这种表达减少与额叶皮质中树突棘密度、成熟蘑菇状棘、树突长度和树突分枝的小幅但显着的减少有关。来自杂合突变小鼠的分离的皮质神经元显示出类似的异常。野生型 OTUD7A 的表达能够挽救树突棘密度、长度以及蘑菇和粗短棘比例的异常,但候选区域内其他基因 CHRNA7、KLF13(605328) 或 FAN1(613534) 的表达受到影响。无法挽救这些缺陷。然而,CHRNA7 能够拯救树突生长,这表明功能上存在一些潜在的重叠。乌丁等人(2018) 得出结论,OTUD7A 是 15q13.3 微缺失综合征的关键基因。
尹等人(2018) 发现纯合 Otud7a 缺失小鼠断奶前生长延迟、运动里程碑延迟、癫痫样活动增加和发声受损,尽管通过恐惧条件反射和新物体识别测试测量,记忆和学习似乎正常。与野生型相比,纯合子和杂合子小鼠表现出声惊吓反应受损,雌性突变小鼠的前脉冲抑制降低,所有这些都可能代表了精神分裂症的特征。与对照组相比,来自 Otud7a 缺失小鼠的原代皮质神经元表现出树突棘密度显着降低,并且这种缺陷可以通过野生型 Otud7a 的表达来挽救,尽管树突生长或树突复杂性没有明显的缺陷。突变小鼠的初级神经元也表现出兴奋性突触功能的减少。尹等人(2018) 得出的结论是,OTUD7A 缺陷在很大程度上解释了与 15q13.3 缺失综合征相关的人类表型,并且 OTUD7A 在树突棘密度和活性的调节中发挥着重要作用。