ANOCTAMIN 10; ANO10
跨膜蛋白 16K;TMEM16K
HGNC 批准的基因符号:ANO10
细胞遗传学定位:3p22.1-p21.33 基因组坐标(GRCh38):3:43,365,848-43,691,594(来自 NCBI)
▼ 说明
ANO10 属于钙激活氯离子通道家族(Hartzell 等人评论,2009)。
▼ 克隆与表达
Vermeer et al.(2010)指出推导的ANO10蛋白含有660个氨基酸。定量PCR检测到ANO10在所有检查组织中表达,其中在整个成人大脑中表达最高,其次是视网膜和心脏。在特定的成人大脑区域中,在额叶和枕叶皮质以及小脑中检测到最高表达。胎儿脑中的表达低于成人全脑中的表达。
▼ 基因结构
Vermeer et al.(2010)确定ANO10基因全长2.7 kb,包含13个外显子,其中12个是编码外显子。
▼ 测绘
Vermeer et al.(2010) stated that the ANO10 gene maps to 染色体 3p22.3-p21.32. Gross(2011) mapped the ANO10 gene to 染色体 3p22.1 based on an alignment of the ANO10 sequence(GenBank AK096302) with the genomic sequence(GRCh37).
▼ 分子遗传学
3个无关家族的常染色体隐性遗传性脊髓小脑共济失调-10(SCAR10; 613728),Vermeer et al.(2010)鉴定出ANO10基因的纯合或复合杂合突变(613726.0001-613726.0004)。这种神经退行性疾病的特征是在青少年或青年时期发病,出现步态和肢体共济失调、构音障碍和眼球震颤,并伴有脑成像中明显的小脑萎缩。
Balreira等人(2014)在2名患有SCAR10且肌肉中辅酶Q10(CoQ10)水平降低的无关女性中发现了ANO10基因的复合杂合突变;然而,由于变体的描述和/或编号存在差异,这些变体已被重新分类为意义不明的变体(参见613726.0005-613726.0007)。第一个患者的突变是通过全外显子组测序发现的;第二名患者的突变是通过对 36 名肌肉、成纤维细胞或脑脊液中辅酶 Q10 水平较低的个体的 ANO10 基因直接测序发现的。没有进行变体的功能研究。
▼ 等位基因变异体(7个精选示例):
.0001 脊髓小脑共济失调,常染色体隐性遗传 10
ANO10、LEU510ARG
患有常染色体隐性遗传性脊髓小脑共济失调-10(SCAR10;SCAR10;613728),Vermeer et al.(2010)在ANO10基因的外显子10中鉴定出纯合的1529T-G颠换,导致DUF590结构域中高度保守的残基被leu510替换为arg(L510R)。在 300 个对照等位基因中未发现该突变。这个家庭是远亲近亲。
.0002 脊髓小脑共济失调,常染色体隐性遗传 10
ANO10、2-BP DEL、1150TT
来自塞尔维亚的罗姆人血统近亲家庭的 3 名患病同胞患有常染色体隐性遗传脊髓小脑共济失调-10(SCAR10;613728),Vermeer 等人(2010)在 ANO10 基因中发现了一个纯合的 2-bp 缺失(1150delTT),预计会导致外显子 6 发生移码和提前终止。
.0003 脊髓小脑共济失调,常染色体隐性遗传 10
ANO10、IVS9DS、GT、+1
2 名法国同胞患有常染色体隐性遗传脊髓小脑共济失调-10(SCAR10; 613728),Vermeer et al.(2010)鉴定了 ANO10 基因中 2 个突变的复合杂合性:内含子 9 中的 G-to-T 颠换(1476+1G-T),预计会导致剪接位点突变,以及1604位核苷酸缺失,导致535号密码子(L535X)过早终止;613726.0004)。
.0004 脊髓小脑共济失调,常染色体隐性遗传 10
ANO10、1-BP DEL、NT1604
讨论导致 ANO10 基因中 leu535-to-ter(L535X)替换的 1-bp 缺失,该基因在患有常染色体隐性遗传脊髓小脑共济失调 10(SCAR10; Vermeer 等人(2010),参见 613728),参见 613726.0003。
.0005 重新分类 - 意义未知的变体
ANO10,1-BP INS,132T
该变异原名为脊髓小脑性共济失调,常染色体隐性10,由于根据Balreira等人(2014)文章中引用的参考序列,变异编号不一致和/或错误,已被重新分类。
2 名无血缘关系的女性患有常染色体隐性遗传脊髓小脑共济失调-10(SCAR10; 613728)和骨骼肌中低至临界水平的 CoQ10,Balreira 等人(2014)鉴定出 ANO10 基因中的复合杂合突变。两名患者在外显子 2 中均携带 1-bp 插入(c.132_133insT,NM_018075.3),导致 1 个等位基因发生移码和提前终止(Asp45ArgfsTer53)。1 名患者的第二个等位基因携带 c.1843G-A 转换,导致 asp615 到 asn(D615N;rs238000380;613726.0006)C端保守残基的取代;另一名患者的第二个等位基因在外显子 6 中携带 c.1315G-T 颠换,导致 glu382-to-ter(E382X;613726.0007)替代。在千人基因组计划的 1 个样本中发现了杂合 D615N 变化。第一位患者的突变是通过全外显子组测序发现的,在她未受影响的兄弟中没有发现。第二名患者的突变是通过对 36 名 CoQ10 水平低的患者的 ANO10 基因进行直接测序发现的,与她的家族中的疾病分开,并且在 124 名对照者中未发现。没有进行变体的功能研究。注意:在Balreira等人(2014)的文章中,1-bp插入多次被给出为c.132_133insT,但在图1c中为c.132_133insA。此外,c.1315G-T的编号与引用的参考序列不对应。
.0006 重新分类 - 意义未知的变体
ANO10、ASP615ASN(rs138000380)
该变异原名为脊髓小脑性共济失调,常染色体隐性10,由于根据Balreira等人(2014)文章中引用的参考序列,变异编号不一致和/或错误,已被重新分类。
讨论常染色体隐性遗传性脊髓小脑共济失调-10(SCAR10;SCAR10;613728),作者:Balreira 等人(2014),参见 613726.0005。
.0007 重新分类 - 意义未知的变体
ANO10、GLU382TER
该变异原名为脊髓小脑性共济失调,常染色体隐性10,由于根据Balreira等人(2014)文章中引用的参考序列,变异编号不一致和/或错误,已被重新分类。
讨论常染色体隐性遗传性脊髓小脑共济失调-10(SCAR10;SCAR10;613728),作者:Balreira 等人(2014),参见 613726.0005。