含锌指和 BTB 结构域的蛋白质 48;ZBTB48

GLI-Kruppel 家族成员 HKR3;HKR3
癌基因 HKR3
端粒锌指相关蛋白;TZAP

HGNC 批准的基因符号:ZBTB48

细胞遗传学定位:1p36.31 基因组坐标(GRCh38):1:6,579,994-6,589,280(来自 NCBI)

▼ 说明

ZBTB48是一种端粒相关蛋白,参与端粒长度控制(Li et al., 2017)。

▼ 克隆与表达

HKR3是Ruppert等人(1988)鉴定的几个部分表征的锌指基因之一,它们与GLI原癌基因(165230)相关,并且是Kruppel相关基因家族的成员。Kruppel 样锌指蛋白的特征是连接锌指的高度保守的 7 个氨基酸序列,称为 H/C 连接(thr-gly-glu-lys-pro-tyr-X)。Sukawara等人(1994)从人B淋巴母细胞文库中获得了HKR3的cDNA。预测的 77-kD 蛋白质具有 11 个由 H/C 连接分隔的 C2H2 锌指。该蛋白的N末端含有一个轨道相关框(TAB)结构域和一个酸性激活结构域。

Maris等人(1996)通过Northern印迹分析在所有检查的组织中检测到HKR3 mRNA。观察到 2.3 kb 和 1.4 kb 的两个变体。较小的形式缺少 TAB 和激活域。

Li等人(2017)利用FISH免疫荧光分析发现,内源性ZBTB48(他们称之为TZAP)定位于人和小鼠细胞的端粒上。

▼ 基因功能

Li等人(2017)利用截短突变体发现,TZAP的3个末端锌指对于TZAP定位到端粒来说是必需的且足够的。TZAP 在体外与双链端粒 TTAGGG 重复序列结合,以孤立于屏蔽蛋白复合物的方式结合端粒(参见 600951),并且主要结合屏蔽蛋白含量减少的长端粒。在人和小鼠细胞中的过表达和敲除研究表明,TZAP 启动端粒修剪,并快速删除端粒重复序列。

▼ 基因结构

Maris等人(1996)表明HKR3基因包含11个外显子,跨度约9.5 kb的基因组DNA。它距离标记 D1S214 大约 40 kb。CpG 岛出现在基因的 5-prime 区域。

▼ 测绘

Ruppert等(1988)将HKR3定位到染色体1。Maris等(1996)通过荧光原位杂交将HKR3基因定位到1p36.3。

Tags: none